鸡六个免疫候选基因的mRNA表达特性及与IgY含量的关联分析

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本课题组前期利用60K的SNP芯片完成了对北京油鸡血清免疫球蛋白Y(Immunoglobulin Y,IgY)含量、免疫器官重等9个免疫性状的关联研究,筛选得到了影响上述性状的显著关联位点和候选基因。本研究基于此部分结果,以筛选得到的与IgY相关位点附近的候选基因CD1b, BMA1(B locus M alpha chain1) TR1M27(tripartite motif-containing27), ZNF692(zinc finger protein692), IL4I1(Interleukin4-induced1)和GNB2L1(guanine nucleotide binding protein, beta polypeptide2-like1)作为研究对象,在细菌和病毒感染北京油鸡情况下,分析上述基因mRNA表达变化;筛选两个基因在其他品种中进行多态性分析,以此揭示候选基因在免疫反应中发挥的功能,为鸡免疫性状相关候选基因的筛选及分子遗传机制提供理论基础。试验一:以北京油鸡为实验材料,随机选取100只12日龄雏鸡分为三组:空白对照组、聚肌胞(Polyinosinic acid-polycytidylic acid, Poly I:C)处理组和肠炎沙门氏菌(Salmonella enter itidis,SE)处理组,于人工注射胸肌后第12h、24h、3d和6d (days post infection, DPI)检测血清炎症因子的变化水平和候选基因组织表达规律。分析结果表明,经过聚肌胞和SE感染后血清中IgY、IFN-a, IL-4和IL-6水平显著高于空白组。聚肌胞处理组中TRIM27, ZNF692和GNB2L1在法氏囊中相对表达量与血清IgY变化趋势一致,上述基因可能与聚肌胞感染引起的免疫反应有关。SE感染后,IL4I1的相对表达量在三个免疫器官中高表达,而且在脾脏中的相对表达与IgY含量变化趋势相同,说明IL4I1可能在肠炎沙门氏菌的感染过程中发挥作用。BMA1在两处理组中的胸腺中表达高,说明其可能主要在胸腺中发挥免疫调节作用。候选基因ZNF692和GNB2L1的mRNA水平变化说明其主要在两处理组鸡的法氏囊中发挥免疫作用。试验二:选取白来航鸡为试验材料,56日龄翅静脉采血,检测血清中IgY含量,采用直接测序的方法检测基因IL4I1和GNB2L1调控区和外显子区的多态位点,测序结果显示IL4115’调控区存在一个CA的突变,exon2中2330位存在CT突变,exon6存在两个突变C4075T和C4090T,四个位点的野生基因型频率高;基因GNB2L1发现外显子2存在两个突变C1203T和C1261T,第8个外显子区域第3838位发生了GA突变,其中C1261T的突变杂合子基因型CT频率高于CC和TT基因型,这七个突变位点都属于中度多态。与IgY含量关联分析的结果显示:IL4I1中C4075T和C4090T突变基因型CT血清IgY含量极显著高于CC和TT基因型(P<0.01),GNB2Ll基因的C1203T、G3838A的突变杂合子基因型血清中IgY含量显著高于正常基因型鸡血清IgY含量(P<0.05)。单倍型分析结果显示三个突变位点C4075T、C4090T和C1203T是连锁的,其中单倍型CCCCCTG在群体中出现的频率最高,IL4I1中C4075T和C4090T, GNB2L1基因的C1203T突变位点与血清IgY相关,说明这两个基因确实是与抗体相关的功能基因。
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