论文部分内容阅读
目的:了解2012-2014年长沙地区HAdV的分子流行病学特征;比对分析HAdV的14、55、57型结构蛋白基因的同源性及差异性,为HAdV的防控及进化演变提供实验依据。方法:收集2012年4月至2014年3月因急性下呼吸道感染在湖南师范大学第一附属医院(湖南省人民医院)儿童医学中心住院儿童且经前期实验鉴定为HAdV阳性的鼻咽抽吸物及肺泡灌洗液标本,进行分型;选取其中14、55和57型样本,采用细胞培养技术分离病毒;提取其核酸,通过PCR方法扩增fiber、hexon、penton结构蛋白基因以及14、57型全基因并测序;采用Meg4、Aligmen和DNAman等基因软件对其基因序列进行比对分析并构建进化树。结果:1.本实验成功分型的221例样本,分属于B、C、E三个亚组。其中7型112例(50.68%)、3型22例(9.95%)、14型9例(4.07%)、55型2例(0.90%)、21型1例(0.45%)、1型26例(11.76%)、2型25例(11.31%)、5型7例(3.17%)、6型3例(1.36%)、57型3例(1.36%)、4型11例(4.98%);2.HAdV-57型长沙株的全基因组在结构蛋白基因区有碱基突变,fiber及penton存在个别氨基酸替换和变异,各结构蛋白基因及全基因组与genbank中的样本比对,相似度均为99%;3.hadv-14长沙株的全基因组在结构蛋白基因区无碱基突变,与genbank中近年国内外基因样本同源性高;4.长沙地区hadv-14型和55型的penton基因与郴州、兰州地区的相似度为100%,且与genbank中多个样本的相似度为100%;5.长沙地区hadv-55型的fiber基因与郴州地区的相似度为100%,与genbank中来自中国大陆不同地区及不同时间的多个样本相似度为100%,但与兰州地区的相似度为99%;长沙地区hadv-14型的fiber基因各样本间相似度为100%,与兰州地区的大部分及genbank中多数样本的相似度亦为100%,与郴州及兰州地区的个别样本相似度为99%;6.长沙地区hadv-55型的hexon基因与郴州、兰州地区的相似度为100%,与genbank中多数样本的相似度亦为100%;长沙地区hadv-14型的hexon基因各样本间相似度为100%,与郴州、兰州地区的大部分及genbank中多数国内样本的相似度亦为100%;7.hadv-14型和55型的基因组的主要差异位于hexon基因,差异性达8%,而这两种型别的fiber及penton基因的差异性仅为0-0.5%。结论:本研究期间内,长沙地区hadv主要流行型别较前期有变化,以7型、1型、2型为主要流行株;hadv-14型基因组相对稳定;hadv-57型基因组具有时间及空间进化特性;hadv-55型和14型结构蛋白基因相对稳定。