【摘 要】
：
背景和目的:前列腺癌（Prostate Cancer,PCa）是世界范围内老年男性最常见的上皮性恶性肿瘤之一,也是男性癌症死亡的第五大原因。目前,前列腺特异性抗原（PSA）是前列腺癌的一种诊断指标,但是出现了假阳性以及诊断过度的现象。其中,前列腺癌患者在经过雄激素剥夺治疗后更有几率进展成为去势抵抗性前列腺癌,其预后较差,因此,构建一种稳健的前列腺癌风险预后模型来区分高低风险患者是必要的。铁是与人类
【基金项目】
：
项目名称:广西医科大学杰出青年人才培养计划,项目合同编号:无,项目来源:广西医科大学,项目起止时间:2017.2.1-2022.1.31； 项目名称:基于高通量测序探索冠状病毒等呼吸道病毒宿主溯源的研究,项目合同编号:桂科 AB20059002,项目来源:广西壮族自治区科学技术厅,项目起止时间:2020.3.1-2021.10.31；
论文部分内容阅读
背景和目的:前列腺癌（Prostate Cancer,PCa）是世界范围内老年男性最常见的上皮性恶性肿瘤之一,也是男性癌症死亡的第五大原因。目前,前列腺特异性抗原（PSA）是前列腺癌的一种诊断指标,但是出现了假阳性以及诊断过度的现象。其中,前列腺癌患者在经过雄激素剥夺治疗后更有几率进展成为去势抵抗性前列腺癌,其预后较差,因此,构建一种稳健的前列腺癌风险预后模型来区分高低风险患者是必要的。铁是与人类健康密切相关的微量元素之一,不仅参与氧气运输、细胞呼吸、免疫功能、CO代谢和DNA合成,同时,铁离子也介导铁死亡发生,可促进细胞的死亡,在肿瘤的治疗中发挥重要作用。本研究使用两样本孟德尔随机化法来探索铁与前列腺癌之间的因果关系,观察铁死亡过程中铁离子的变化,建立以铁死亡相关基因为基础的预后模型,验证预后模型中关键基因对前列腺癌的影响。方法:本研究步步递进的来探究铁死亡对前列腺癌的影响,共由三部分组成。第一部分是探究铁与前列腺癌的因果关系以及前列腺癌发生铁死亡过程中铁离子浓度的变化,首先从铁状态的全基因组关联研究中提取出与铁状态密切相关(P＜5×10-8)的单核苷酸多态性（SNPs）作为工具变量,进一步在PRACTICAL数据库中选出对应的遗传位点,运用目前在因果推断较为有效的孟德尔随机化法来探索铁与前列腺癌之间的因果关系。同时,使用CCK8观察前列腺癌细胞在发生铁死亡时其增殖抑制情况,通过透射电镜观察前列腺癌细胞内线粒体形态变化以及使用铁离子比色法监测细胞内铁离子浓度的变化。第二部分为基于铁死亡相关基因构建前列腺癌患者的预后模型。在确定铁与前列腺癌存在因果关系时,第二部分研究从TCGA数据库下载前列腺癌患者的转录组表达数据及相应的临床资料,从Ferr Db数据库获取铁死亡的相关基因数据,以铁死亡相关基因为基础与TCGA表达矩阵的基因取其交集,进行差异表达基因的分析。随后,使用LASSO和COX回归构建多基因预后模型。基于预后模型将前列腺癌患者划分为高、低风险分组。通过高、低风险组,进行组间的差异基因分析。最后,根据风险差异表达基因进行GO分析、KEGG分析和ss GSEA分析。第三部分为AKR1C1过表达对前列腺癌细胞功能的影响,通过第二部分构建预后模型筛选出AKR1C1具有预后价值的差异基因,第三部分研究通过q PCR检测AKR1C1在PC3、DU145和LNCap中的表达情况,筛选最佳的质粒转染的目的细胞。通过质粒转染使AKR1C1在前列腺癌细胞中过表达,运用Transwell迁移实验检测AKR1C1过表达的前列腺癌细胞的迁移能力。结果:在第一部分研究中,从全基因组关联分析的数据中得到了11个与铁状态强相关的SNPs作为工具变量。在传统组中,铁状态与前列腺癌存在因果关系（OR:0.879,95%CI:0.813-0.950,P=0.001）。同时,在自由组中,血清铁与前列腺癌存在因果关系（OR:0.910,95%CI:0.833-0.995,P=0.039）,其他三种铁的生物标记物（转铁蛋白饱和度、铁蛋白和转铁蛋白）与前列腺癌之间无显著因果关系（P＞0.05）。同时,铁死亡诱导剂Erastin不仅能够抑制PC3、LNCap和Du145的存活并诱导其死亡,而且前列腺癌细胞活力随着erastin浓度增加而下降,在经erastin诱导的前列腺癌细胞的线粒体形态也发生改变。并且,Erastin诱导细胞发生铁死亡后其细胞内铁离子水平随着erastin浓度增加升高。在第二部分研究中,发现24个铁死亡相关基因在前列腺癌样本和正常组之间存在差异性表达,筛选得到了18个既有表达差异又有预后价值的交集基因,通过LASSO和COX回归构建了一个以7个铁死亡相关基因（NOX1,VDAC2,ALOX12,BAP1,MIOX,AKR1C1,BNIP3）为基础的预后模型,在7个铁死亡相关基因中,AKR1C1与癌旁组织相比在前列腺癌组织低表达。同时,通过预后模型将患者分成高、低风险两组人群。与低风险组相比,高风险组总体生存率明显降低（P＜0.001）。并且,通过时间依赖的ROC曲线计算得到1年内,2年内,3年内的AUC值为0.988,0.936,0.861。第三部分研究发现PC3和LNCap细胞的AKR1C1表达量远低于DU145,但AKR1C1表达量在PC3和LNCap中相近,由于PC3细胞生长快,选择PC3作为AKR1C1过表达转染的目的细胞。AKR1C1在PC3细胞中表达后,抑制了PC3细胞的迁移。结论:基于两样本孟德尔随机化法,以SNP作为工具变量预测出铁与前列腺癌风险存在因果关系,铁离子在诱导前列腺癌发生铁死亡过程中发挥着重要作用,通过对铁离子的调控可一定程度对前列腺癌进行防控和治疗。同时,筛选出了7个具有预后价值的差异基因,以这7个铁死亡相关基因为基础而构建的预后模型可对高低风险的前列腺癌患者进行有效的区分,为避免前列腺癌患者发生过度治疗提供一种参考。AKR1C1在前列腺癌的迁移中发挥着重要作用,一方面为更加深入的研究AKR1C1在前列腺癌铁死亡中的作用提供了基础,另一方面也证实了前列腺癌预后模型的作用。
其他文献
目的:马尔尼菲篮状菌（T.marneffei或TM,原名马尔尼菲青霉菌）可在感染人类免疫缺陷病毒（HIV）患者及免疫功能低下人群中引起致命的全身性真菌病,然而传统的组织培养或体液培养等诊断方法耗时长,不能做到早期诊断,诊断灵敏度不理想。因此,本文提出基于人工智能算法,构建多种分类器模型对马尔尼菲青霉病的临床病例信息及实验室检验数据进行学习训练,对各个模型进行分类性能对比,并寻找用于区分AIDS/H
目的:骨关节炎（OA）是一种慢性退行性关节疾病,累及整个关节,包括关节软骨、软骨下骨、滑膜及关节周围组织等。OA的发病因素很复杂,多涉及关节应力、氧化应激、激素、炎症因子等。已有研究表明,氧化应激是OA的关键因素,氧化应激会导致细胞分解代谢的失衡,损伤DNA和蛋白质,促进软骨细胞凋亡,还可以促进细胞外基质的降解。滑膜中促炎M1型巨噬细胞的激活会导致的OA恶化,而冗余活性氧（ROS）是驱动巨噬细胞向
目的:膀胱癌是常见的泌尿系统肿瘤,具有易复发预后较差的特点。肿瘤微环境具有广泛的异质性,并在肿瘤进程和治疗反应中起着关键的作用。为了探究膀胱肿瘤免疫微环境中自然杀伤（Natural killer,NK）细胞和树突状细胞（Dendritic cells,DC）的特征,了解NK细胞和DC的异质性以及这两种细胞在肿瘤微环境中的相互作用关系,为提高膀胱癌免疫治疗的精准程度和疗效提供新的思路和依据,我们用单
背景肠道微生物组是一个复杂的系统,与人类的活动密切相关,随着抗生素广泛使用于临床及养殖畜牧业,造成大量耐药细菌甚至超级细菌的产生。灵长类动物在系统进化上与人类最为接近,对他们肠道微生物的组成和耐药性进行系统分析,有助于我们解释宿主生活方式和地理环境对肠道微生物特征以及耐药性的影响。然而,大量微生物在实验室条件下不可培养。宏基因组测序不需要经过分离培养,直接提取样本总DNA,获得大量有利信息。但是,
目的:本课题旨在探讨和研究经过甲基丙烯酸酐（MA）改性的刺槐豆胶水凝胶诱导骨髓间充质干细胞（BMSCs）增殖和成软骨分化能力以及修复缺损软骨组织的作用。方法:第一部分方法:刺槐豆胶水凝胶的光固化可注射改性与表征:将1.0 g刺槐豆胶（LBG）溶在100 ml的去离子水中,水浴搅拌加热到50℃时,再将3 ml的MA溶液加到LBG水溶液中,然后将LBG水溶液调至中性后反应6 h。透析和冻干后所得就是本
作为政府公共管理过程中的主要决策依据,统计数据的质量直接影响了政府制定政策的科学性和可行性。在新时代背景下,统计工作受到了前所未有的重视,对统计数据质量也提出了越来越高的要求。改革开放四十年来,在提升统计数据质量方面,我国政府做了很多探索,取得丰硕成果,但更多的是理论层面,实际应用方面的制度方法研究较少。在我国,县乡的基层政府统计机构作为数据获取的“第一道关口”,严守第一关口和中间环节“没有假数”
背景:靶点的确认与发现对明确药物的作用机制及药物修饰改造具有重要作用。课题组前期合成的系列大黄酸衍生物对多种肿瘤细胞增殖和转移有明显的抑制作用,而近期合成的含氮甲酰胺蒽醌修饰物是否调控Rac1活性及其靶点蛋白尚未明确。目的:以Rac1蛋白为靶点,利用分子对接软件评价设计合成系列含氮甲酰胺蒽醌修饰物与Rac1的结合能力,通过含Rac1启动子的萤光素酶报告基因系统确认含氮甲酰胺蒽醌修饰物调控Rac1活
背景与目的:烟碱型乙酰胆碱受体（n ACh R）是一类介导突触间快速信号传递的配体门控离子通道蛋白受体,广泛分布在中枢和外周神经系统及肌肉中,分神经型和肌肉型两大类。n ACh R各亚型与一系列神经系统疾病,如神经疼痛、神经紊乱、老年痴呆帕金森症等密切相关,是研发这些疾病的重要药物靶点。目前已发现部分芋螺毒素以及金银环蛇毒素均作用于n ACh R,一些芋螺毒素具有强镇痛活性（如Vc1.1、Rg I
近些年来,丽江市立足于旅游资源优势,借助旅游发展的机遇,大力推进和发展旅游品牌,旅游市场不断扩大,旅游经济收入不断增长,旅游已经成为丽江市经济收入的主要组成部分之一。然而,随着旅游的不断发展以及消费需求的不断增长,丽江市旅游市场中强迫性消费、擅自修改旅游行程、价格不合理等扰乱旅游市场的现象不断出现,对丽江市旅游业带来了恶劣的影响。因此,加强丽江市旅游市场秩序治理势在必行。本论文对旅游市场秩序治理相
就业是最大的民生。我国每年有大量退役士兵需要以自主就业的方式进行安置,在严峻的就业形势下,退役士兵普遍存在就业率低、就业质量不高的问题。因此,促进广大退役士兵充分优质地就业,对于凝聚军心士气和保持社会和谐稳定具有重要意义,也是各级政府亟待解决的难题。近年来,国家出台了一系列鼓励和扶持退役士兵就业的法规文件,其中都把加强对退役士兵的职业教育和技能培训提到了前所未有的高度。云南省积极开展退役士兵职业培