精神分裂症是一种严重的精神疾病，发病率大约为1％，多数病人终身不愈。遗传因素对该疾病有很重要的影响，多年来为了寻找与精神分裂症相关的DNA序列上的变异，研究者付出了巨大的努力。然而该病的遗传方式非常复杂，并不符合简单的孟德尔遗传规律。另外，未知的环境因素可能也有一定的影响，再加上该疾病诊断上的不明确，这些都使得遗传分析至今还没有获得令人满意的结果。 在本文中，笔者基于对复杂遗传病的理论研究，首先开发了两个统计分析工具：一个是针对传统关联分析的网络平台SHEsis；另一个是针对基因问相互作用分析的、适用于大规模遗传分析的算法PDSE。SHEsis使得关联分析所需的一系列统计量可以很直观快速地被研究者获取；PDSE则可以在过去知之甚少的易感基因相互作用／上位效应分析上起到重要作用。 然后，笔者在收集到的来自上海和吉林的样品中进行了遗传背景研究，确保了在这些样品上进行关联分析不会导致假阳性结果。另外，在增加了瑶族和布依族的样品后，对实验样品中存在的遗传背景划分作了分析。 接着，笔者选择了10个候选基因，进行基于基因的关联分析研究。在对SLIT3(65个SNP)，DTNBPI(7个SNP)，CAAPON(4个SNP)，TNFB(4个SNP)，DBH(3个SNP)，DRD3(1个SNP)，DISCl(4个SNP)，COMT(2个SNP)，PIK4CA(1个SNP)，ZDHHC8(1个SNP)总共10个基因92个SNP位点进行了单个位点和单倍型的关联分析(主效应)。最后，ZDHHC8基因在汉族上海样品中表现出强的阳性结果，验证了Chen WY et al．的结论。其在吉林和上海样品中表现出的遗传异质性也可以解释国际上有关该基因的互相矛盾的结论产生的原因。在DTNBPl基因与精神分裂症的相关性研究中，我们在rs9476837和rs9464794以及rsll755055-rs9476837-rs9464794三个位点的单倍型分析结果中得到了一定的阳性结果。但是由于位点频率较低(低频等位基因频率均低于O.1)，而且Odds Ratio值在1.4～1.6的区间，在考虑了多重检验校正的情况下，统计力度还不够，还需要加大样本量验证。 最后，笔者利用PDSE对所研究位点间的易感上位效应(相互作用)进行了分析。DTNBPJl基因的rsll755055和rs9464794之间的相互关系呈现出很强的阳性结果(p=5.87e-15)，大大增强了我们对DTNBPl基因的兴趣，目前正在酝酿大样本量的验证工作。 总之，在这项研究中，笔者在有限的实验规模上，对决定精神分裂症的易感位点做了一次系统研究的重要尝试，获得了许多有价值的结果。