广西地区慢性丙型肝炎患者NS5A抑制剂天然耐药突变的研究

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目的:探讨广西地区未进行抗病毒治疗的慢性丙型肝炎患者NS5A抑制剂天然耐药突变情况。方法:(1)采集233例患者治疗前的外周静脉血,将样本送武汉康圣达医学检验中心检测基因型;(2)提取患者的HCV RNA,设计针对HCV NS5A区域的特异性引物进行巢式PCR扩增;(3)PCR产物送上海生工生物有限公司测序,测序结果与基因库序列进行比对,鉴别出耐药突变位点。结果:(1)入选的233例患者样本中有214例扩增并测序成功,慢性丙型肝炎191例,丙肝肝硬化23例,其中基因1a型19例,基因1b型100例,基因3a型23例,基因3b型30例,基因6a型42例;(2)214例扩增成功的样本中有76例(35.5%)检测出相关位点突变,其中56例(26.2%)为单位点突变,20例(9.3%)为两个位点联合突变;(3)基因1型119例,有53例(44.5%)患者检测出相关位点突变。其中基因1a型有7例(36.9%),突变位点为Q30H(n=1,5.3%),H58P(n=1,5.3%),M28T+H58P(n=1,5.3%)和H58P+E62D(n=4,21.0%);基因1b型有46例(46.0.0%),突变位点为R30Q(n=23,23.0%),Y93H(n=6,6.0%),Q54H(n=5,5.0%),P58S(n=4,4.0%),Q54H+P58S(n=4,4.0%),L31M+R30Q(n=2,2.0%)和Q54H+R30Q(n=2,2.0%);(4)基因3型53例,有19例(35.8%)检测出相关位点突变。其中基因3a型有9例(39.1%),突变位点为A30K(n=2,8.7%),L31M(n=1,4.3%)和A30K+L31M(n=6,21.0%);基因3b型有10例(33.3%),突变位点为M28L(n=1,3.3%),K30A(n=1,3.3%),M31L(n=3,10.0%),T54A(n=4,13.4%)和K30A+M31L(n=1,3.3%);(5)基因6a型42例,有3例(7.2%)出现了相关位点突变,突变位点为F28V(n=1,2.4%),T58P(n=1,2.4%)和T93A(n=1,2.4%);(6)各个基因型突变率两两比较:基因1型和基因3型比较(44.5%VS 35.8%),P=0.286>0.05,差异无统计学意义;基因1型和6型比较(44.5%VS 7.2%),P=0.000<0.05,差异有统计学意义;基因3型和基因6型比较(35.8%VS 7.2%),P=0.001<0.05,差异有统计学意义;(7)丙肝肝硬化患者耐药突变检出率为47.8%,高于慢性丙型肝炎患者的检出率34.0%,P=0.000<0.05,差异有统计学意义。结论:(1)广西地区未进行抗病毒治疗的丙型肝炎患者存在NS5A抑制剂的天然耐药位点突变,既有单位点突变,也有两个位点联合突变;(2)基因1型和基因3型患者的突变率高于基因6型患者;(3)丙肝肝硬化患者的耐药突变率高于慢性丙型肝炎患者的突变率,耐药突变可能与肝硬化的发生有关。
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