由于生鲜农产品具有易腐易逝、短生命周期等特点,在实际经营过程中,为保证产品的新鲜度,提高销售量,生鲜企业通常需要投入大量的资金来购买冷链设备。加上市场需求的不确定,加剧了生鲜农产品供应链运营的困难,使其陷入了“投资大、利润薄”的困境。为此,中国政府围绕“保供应、稳价格”积极推进公益性农产品市场建设,各地政府每年都要投入一定的专项财政补贴资金。然而,在实施补贴政策的过程中,由于补贴方式、补贴主体、补贴策略的不同,各项激励策略效果存在差异,尤其是考虑到受财政补贴预算、公益性等因素的影响,导致政府实施补贴的效果难以确定。鉴于此,本文综合运用博弈论、决策优化、契约设计、政府补贴与数值仿真等方法,针对由一个生鲜供应商（或生产商）和一个生鲜销售商组成的供应链,考虑消费者需求不确定,研究生鲜农产品供应链的政府补贴策略问题,并分析关键因素对政府补贴政策有效性及供应链系统决策变量的影响。首先,针对政府补贴如何影响考虑公益性的生鲜冷链保鲜投入问题,在需求不确定环境下,通过构建分散式和集中式生鲜冷链保鲜投入补贴博弈模型,分析了生鲜供应商的公益性对最优决策和均衡结果的影响,并对比分析了分散式决策与集中式决策下政府补贴生鲜冷链保鲜投入的差异效果。在此基础上,设计了“成本分担”契约和“收益共享+转移支付”契约对补贴策略进行改善,并分析了这两种契约对最优决策的影响。研究发现:当生鲜供应商通过扩大供给和平价销售加强公益性时,政府适当强化生鲜供应商的公益性可有效改善社会福利,补贴策略有效。然而,政府过多地强化公益性会使供应链整体利润为负,并且使得补贴策略无法执行。集中式决策下政府补贴改善社会福利的效果优于分散式决策,但此时供应链利润受公益性的影响较大,补贴策略易失效。成本分担契约能有效扩大公益性执行区间,增加生鲜农产品的市场供应,提升冷链保鲜投入,并实现社会福利的帕累托改善。而在一定条件下,组合式契约可以使分散式决策实现完美协调。其次,针对政府如何选择合适的主体对生鲜农产品供应链进行补贴的问题,在需求不确定环境下考虑公益性的影响,分别构建无政府补贴、补贴供应商、补贴销售商以及补贴消费者四种情形的博弈模型。通过比较分析得到政府的最优补贴策略,并考察了生鲜销售商公益性对补贴策略以及供应链最优决策的影响。最后,结合数值算例进一步分析了公益性对不同补贴策略相对优势的影响。研究发现:当生鲜销售商通过平价或微利销售加强公益性时,这会对供应链各成员的盈利能力产生不同的促进作用,进而影响到政府的补贴策略选择。从改善社会整体福利的角度来说,当单位补贴较低时,政府补贴供应商是它的最优策略;而当单位补贴较高时,政府对销售商和消费者实施补贴为最优策略,且两者的补贴效果相等。公益性与补贴资金杠杆率负相关,过多地强化销售商的公益性将降低财政补贴的效率。然后,针对政府如何对生鲜农产品供应链的销售端进行补贴的问题,在需求不确定环境下考虑财政资金的约束,分别构建了无政府补贴、采购补贴和销售补贴三种情形下的博弈模型。考察了财政补贴资金对采购补贴和销售补贴策略有效性的影响,通过对比分析得出了政府的最优补贴策略,并探讨了补贴策略对生鲜供应链最优决策的影响,最后用数值算例进一步说明了不同补贴策略对不同类型生鲜农产品的影响。研究发现:补贴策略的选择与财政预算密切相关,当政府的财政预算充裕时,两种补贴策略都有效且可行,都能平抑物价、增加供给、拉动需求;从改善社会整体福利的角度来看,政府实施采购补贴为最优策略;从补贴资金效率的角度来看,政府实施销售补贴为最优策略。在销售补贴预算充裕而采购补贴预算存在缺口时,政府应该实施销售补贴策略,该策略能有效改善消费者剩余和社会整体福利。在财政预算不足时,政府不应该实施任何补贴,它的最优策略是不干涉市场的运营。最后,针对政府选择何种补贴策略以有效干预生鲜农产品供应端而大力发展产地初加工的问题,在需求不确定环境下考虑政策组合的影响,分别构建了无政府补贴、对生产商实施增值税减免、生产成本补贴、增值税减免加生产成本补贴四种情形的博弈模型。首先考察了增值税税率对各成员收益和应纳增值税的影响,其次从改善社会整体福利的视角研究了政府的最优补贴策略,分析了不同补贴策略对生鲜供应链均衡决策的影响。研究发现:当政府实施增值税政策时,其征收的增值税随税率的增大呈先递增后递减的规律,并且提高税率对供应链各成员收益带来的负向影响将从生产端向消费端逐级加强。考虑政府补贴成本后,随着单位补贴率的增大,政府的最优补贴策略依次为组合策略、生产成本补贴策略、增值税减免策略,这三种策略均可有效平抑物价、扩大供给、提升新鲜度,并且增强生产商和销售商的盈利能力、提升纳税能力。