中部六省是我国重要的工业基地，企业R&D效率与地区经济发展存在高度联系，随着中部六省自主创新战略的实施推进，有必要适时跟踪了解企业R&D投入产出效率情况，这对于企业更好地开展R&D活动、力推中部崛起提速，具有重要意义。本文以2008年国家第二次经济普查及《全国工业企业科技活动统计资料-2011》提供的数据为依据，运用数理统计方法及数据包络的相关模型，对我国中部各省份大中型工业企业的R&D投入产出效率进行评价。在指标的选取上，参照国际通用R&D活动的指标划分标准，以参与R&D活动人员、R&D投入经费为投入指标，以新产品产值、专利申请数为产出指标，利用BCC和CCR两种常用的DEA评价模型，以6个省份以及中部总体和全国为决策单元，对中部地区工业企业的投入产出效率做出评价。结果显示，中部各省大中型工业企业R&D活动不仅在规模上存在差异,而且利用效率也存在较大的差距。针对DEA无效的省份，进一步分析了无效的原因，以及对无效单元目标改进和效率值改进的方向，提出解决方案，从而使得对中部工业企业科技活动有效性的研究更加深入、具体，研究结论可以为相关部门的决策提供科学依据。