近年来,突发公共卫生事件频发,对人们的身体健康与生命安全产生极大的危害。疫情的有效防控成为各国关注的焦点。科普短视频的兴起,为健康传播提供了新的传播手段。作为一种新兴的传播媒介,科普短视频具有将大众传播和人际传播相结合的优势,其时效性和传播广度也达到历史峰值,为突发公共卫生事件背景下的健康传播提供了新的机遇。因此,发挥其在突发公共卫生事件背景下的社会影响研究极具理论和现实意义。2019年12月8日,官方通报武汉市不明原因肺炎患者发病,2020年1月12日,世界卫生组织（WHO）正式将其命名为2019-n Co V（新冠肺炎）;作为突发公共卫生事件,在新冠肺炎疫情期间,所有国家都面临这场前所未有的严重疾病带来的多维度侵害。为妥善应对与及时止损,必须使社会意识到普及健康知识和技能、提升民众科学素养的重要性。本文首先详细阐释了突发公共卫生事件背景下医学类科普短视频的定义,梳理了其发展历程,分析了医学类科普短视频与健康传播的关系。然后,以突发公共卫生事件背景下医疗类科普短视频的传播内容作为研究重点,进行研究设计和样本分析。并以医学类自媒体“丁香医生”为切入点,运用内容分析法收集符合定义的有效样本,从主题、标注内容来源等十一个指标进行记录,并基于用户行为的方法将社会影响力进行量化,分析短视频的传播内容与社会影响的相关性,初步得出结论。最后,笔者根据社会影响理论,构建出突发公共卫生事件背景下医疗类科普短视频的社会影响测量指标体系,运用问卷调查、深度访谈两种实证研究方法探析突发公共卫生事件背景下医疗类科普短视频的社会影响力及影响因素,得出最终结论。根据以上调查结果,笔者发现医疗类科普短视频健康传播产生社会影响的过程中存在平台缺乏专业标识,粉丝留存率低,传播主体权威机构缺位,健康信息与商业广告混杂,对老年群体的防疫宣传不力等问题。针对以上问题提出了平台增加专业标识,加大审核与惩戒力度;提升视频质量,增强粉丝粘性;鼓励权威机构入场,提高医学专业人员参与创作的比例;自律与他律相结合,控制商业广告;拓宽传播渠道,强化对老年群体的防疫宣传力度等对策。以希为突发公共卫生事件背景下医疗类科普短视频的有效传播,更好地进行疫情防控提供借鉴与参考。