肝细胞癌IncRNA表达谱研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yh124712
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景
  肝细胞癌在全世界恶性肿瘤中其发病率和死亡率分别排在第六位和第三位。我国的新发肝细胞癌病例数占全世界所有新发病例数的55%。肝细胞癌与慢性乙型肝炎病毒感染密切相关,50%的肝细胞癌病例是由HBV感染导致。五年生存率只有5~6%,预后极差,造成严重的经济损失和沉重的社会负担。从正常的肝细胞演变为肝癌细胞直至发生最后的转移需经历多个病理阶段、发生多种分子事件改变。因此,阐明肝细胞癌的临床病理特征与其分子改变之间的关系,以发展出新的诊断和治疗策略,改善患者的预后,就成为当前迫切的需求和巨大的挑战。
  人类的基因组的组成除了编码蛋白质的组分,还包括数量远大于编码组分的非编码组分(超过97%)这些组分在疾病过程中也起着至关重要的作用。长链非编码RNA (long non-coding;RNAs,lncRNAs)为数众多,但目前相关研究还非常缺乏。已有证据表明lncRNA在多种生理过程中发挥着极其关键而多样的调节功能,与包括癌症在内的多种致命性的人类疾病有密切关联。但是,有关lncRNA在肝细胞癌中所起的作用的研究还处于起步阶段,对其在肝细胞癌中的临床意义还知之甚少。
  研究目的
  发现肝细胞癌特异IncRNA表达谱。探索这些特异表达的lncRNA作为肝细胞癌诊断标记物的可行性。
  研究方法
  研究所用的病例都来自北京协和医院肝脏外科,时间跨度从2011年3月到2013年7月。选择了29例经病理学检查证实的肝细胞癌患者。所有受试者都接受了肝脏切除术,并在手术后立刻采集了组织样本。提取总RNA。首先利用人类IncRNA芯片检测了肝细胞癌组织和癌旁非肿瘤肝组织之间的lncRNA差异表达谱,然后选择其中5个lncRNA用qRT-PCR方法进行了定量验证。研究结果
  人类lncRNA芯片检测发现659个lncRNA在肝细胞癌组织和癌旁非肿瘤肝组织之间存在表达水平差异。从中选择的5个lncRNA (TCONS_00018278,AK093543,D16366,ENST00000501583,NR_002819 (MALAT1))进行定量验证发现,与癌旁非肿瘤肝组织相比,其中TCONS_00018278,AK093543,D16366,ENST00000501583在肝细胞癌组织中的表达水平出现显著下调(P=O. 012,0. 045,0.000 and 0.000),而NR_002819 (MALAT1)在两种组织中的表达水平则没有显著性差异(P=O. 114)。
  研究结论
  新一代的人类lncRNA芯片检测技术为lncRNA表达谱研究提供了良好的平台。肝细胞癌组织和癌旁非肿瘤肝组织之间存在大量的差异表达的lncRNA。lncRNA TCONS一00018278,AK093543,D16366,ENST00000501583在肝细胞癌组织中的表达水平存在显著下调,为肝细胞癌的早期诊断和治疗提供新的思路。lncRNA MALAT1在肝细胞癌中的表达及意义还需要进一步评价和研究。
其他文献
目的:①初步探索构建一个旨在适应我院临床工作需要的肿瘤病例全程管理系统;②应用上述系统收集我院2006年至2013年期间收治的青少年结直肠癌患者病历资料,探讨其临床特点。  方法:①以VisualBasic6.0作为开发语言,MicrosoftSQLServer2000作为数据库管理系统,采用C/S架构,通过系统设计、数据库建立、代码编写、特殊算法设计、运行调试构建一套肿瘤病例全程管理系统,实现预
学位
目的:总结肝细胞腺瘤(hepatocellular adenoma,HCA)的诊治经验,探讨HCA的临床特点及治疗方法。并通过Meta分析比较实时CEUS、CT及MRI对HCA的诊断价值。  方法:回顾分析33例肝细胞腺瘤患者(其中广西医科大学附属肿瘤医院2002年1月-2013年11月收治12例及广西医科大学第一附属医院2005年1月-2012年11月收治21例)的临床资料并复习文献。所有患者随
目的:研究间歇性外斜视儿童患者与正常儿童的集合、调节相关参数,比较分析两者之间的差异以及差异产生的原因;分析间歇性外斜视儿童患者眼位控制力与集合各因素的关系,探讨间歇性外斜视眼位控制力与集合参数的相关性。  方法:2014年1月至2015年1月于青岛大学附属医院眼科被确诊为基本型间歇性外斜视患者96例,年龄6-12岁;对照组为相应年龄段的正常儿童,近方40cm处隐斜度在-6△~+2△之间,远方隐斜
学位
目的:肉毒中毒(Botulism)是由肉毒梭状杆菌在严格厌氧环境中分泌肉毒毒素(Botulinum neurotoxins,BoNTs)引起的疾病。肉毒中毒根据肉毒杆菌中毒途径不同可分为食源性、婴儿性、创伤性、吸入性及医源性肉毒中毒。目前食源性肉毒中毒占绝大多数,我国也以食源性肉毒中毒多见,多发生在长江以北地区,呈散发状态,河北地区的肉毒中毒以B型为主,近年来的病例标本检测出A和B两型。2007年
学位
目的:分析乳腺超声影像学报告及数据系统(BI-RADS-US)诊断乳腺癌的价值,研究BI-RADS-US系统评估乳腺恶性肿瘤的超声征象与其病理及免疫组化五项指标(ER、PR、HER-2、P53和Ki-67)间的关系。为乳腺癌的诊断、治疗和预后提供可靠的影像学依据,进一步提升BI-RADS-US分级系统的应用价值。  方法:收集2012年8月至2013年11月期间,来我院就诊的87例女性原发性乳腺癌
学位
在本研究中,我们着重探讨了WSKY对精神分裂症大鼠模型中与海马相关的长时程空间记忆障碍的影响,结果表明,WSKY可促进分裂症模型大鼠长时程记忆的形成,量效关系呈倒“U”形。同时,为了深入研究WSKY对分裂症长时程记忆作用的分子机制,我们探讨了WSKY对海马神经元中与长时程记忆相关蛋白表达的影响:一、脑源性神经营养因子(BDNF),作为神经营养因子家族中的重要一员,BDNF在大脑中分布广泛,对神经元
第一章 卵巢上皮癌多药耐药分子机制研究现况  卵巢癌在女性生殖道恶性肿瘤发病率中占第三位,但是死亡率高居第一。化疗是治疗卵巢上皮癌重要手段之一,但多药耐药的产生又是导致化疗失败的中心环节。卵巢上皮癌多药耐药机制十分复杂,目前研究认为可能涉及肿瘤细胞内化疗药物的外排、DNA损伤与修复、细胞凋亡异常和信号传导通路障碍等分子机制,但是至今仍未找到安全有效的逆转耐药靶点。本研究拟通过运用miRNA芯片技术
循环肿瘤细胞( Circulating tumor cell,CTC)是由原发或转移病灶脱落进入外周血的肿瘤细胞,其作为一种实时“液体活检”手段反映了肿瘤是否发生侵袭转移。肺癌、乳腺癌、前列腺癌、结直肠癌等多种恶性肿瘤中的研究均提示,肿瘤诊断初期检测到CTC是疾病不良预后的独立预测因素,CTC检测阳性患者的无进展生存期和总生存期均明显短于CTC检测阴性的患者;而在有效地放化疗、激素治疗或靶向抑制剂
第一部分小鼠趾部切口痛模型中,N-甲基-D-天冬氨酸受体2B亚型相关机制在伤害性刺激对小鼠认知功能影响中的作用研究  研究背景:术后认知功能障碍(POCD)影响患者术后的日常行为活动,并可增加术后的患病率与死亡率,但POCD的发病原因和神经病理学机制仍不清楚。  研究目的:研究趾部切口术引起的伤害性刺激对小鼠认知功能的影响,并研究突触内N-甲基-D-天冬氨酸受体2B亚型(NR2B)相关机制在这一过
学位
第一部分 体外制备锌指蛋白转录活化因子  目的:合成与血管内皮生长因子(VEGF)的启动子结合的锌指蛋白转录活化因子( ZFP-ATF)。方法:利用锌指蛋白(ZFP)软件工具根据VEGF启动子序列合成ZFP结合区,通过基因克隆实验将合成的ZFP结合区及P65激活区的目的基因克隆到PVAXI质粒中,采用双酶切及DNA测序方法进行目的基因检测。结果:ZFP软件合成的ZFP含有6个锌指基序,酶切方法证实
学位