药物研发的过程充满了不可逆性、不确定性和灵活性。因此，新药项目本身具有潜在的期权属性。传统的投资决策方法,例如折现现金流法，比较法等因为没有充分考虑到项目的灵活性价值，往往导致项目价值低估，从而误使企业失去一些有价值的投资机会。本文详细介绍了新药研发的具体过程，分析了R&D项目风险的来源，并比较了传统投资决策方法和实物期权方法的优缺点。针对R&D项目的风险特征，本文引入了复合实物期权的评估方法，并通过案例分析解释了实物期权模型的具体运用方法。复合期权定价的模型有很多种，针对药物研发的具体特征，本文采用二叉树复合实物期权模型评估案例项目的价值，因为二叉树模型直观、易理解，不需要复杂的数学计算，能同时兼顾项目中的技术风险和市场风险比较真实地模拟了决策者决策的过程。通过计算得到的项目期权价值，即灵活性价值，直接导致项目价值的增值，灵活性越高，增值越大。实物期权思想可以帮助管理者看到投资所带来的成长机会，引导决策者制定更为科学的战略决策。