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绿色植物的光合作用对于整个生物界的生存、进化和发展，以及维持自然界的生态平衡具有极其重要的作用。而叶绿体是植物进行光合作用的主要场所。除此之外，叶绿体还参与了光呼吸、硝酸盐和硫酸盐的同化以及植物激素如脱落酸(abscisic acid, ABA)和茉莉酸(jasmonates, JA)的生物合成，因而叶绿体的正常发育和功能维持对植物的生长发育至关重要。
本研究分别以AtcpSecA基因的两个不同T-DNA插入突变体为研究材料，通过对突变体的表型分析、分子鉴定和等位互补实验进一步验证了agy1的表型是由AtcpSecA基因的突变造成的。在外源提供1％蔗糖的正常光照条件下培养，agyl表现为叶片黄白或黄色透明、生长迟滞、植株矮小和不育的表型;弱光处理可以部分恢复其生长迟滞和植株矮小的表型，但是叶片黄白或黄色透明和不育的表型并不能得到恢复。该突变体在黑暗的生长条件下与野生型没有明显的表型差异，但是黄化苗转到正常光照条件下其生长受到严重的抑制。NBT染色实验结果表明在正常光照条件下突变体的叶片有大量超氧阴离子自由基的积累，而在弱光处理2天后积累量明显降低，说明agyl在正常光照条件下遭受了光氧化胁迫。