大力推动土地流转、发展农民专业合作社是推动农业规模经营和实现农业经济发展的重要动力，但目前两项工作的开展都遇到瓶颈，本研究主要通过文献调查法和案例法分别分析了全国土地流转和农民专业合作社发展的问题进行了情况，对河套地区农民专业合作社进行了记录和剖析，分析了河套地区农民专业合作社发展经历的阶段，并以本区典型的农民专业合作社为典型案例，分析了河套地区农民专业合作社发展的现状和特点，找出河套地区农民专业合作社发展过程中遇到的问题，从而提出在现有经济条件下，指出农民合作社的未来发展趋势，进而提出该地区农民专业合作社经营模式的相关对策建议。具体结论和建议:　　(1)加强培训指导，提高专业合作组织带头人的素质，重视人力资本建设;营造有利于农村专业合作经济组织顺利发展的外部资本环境，健全合作组织的内部积累与发展机制，壮大经济实力;落实合作社利润分享政策，保护农民的主体利益。　　(2)政府需要出台积极的产业政策、资金扶持政策、税收政策。　　(3)创建土地流转与合作社经营的有机结合的科学运作模式;维护全体社员利益与培育核心产业（主体）和核心领导层的有机结合;促进跨区合作社产业化联合发展，实现合作社规模化经营。