论文部分内容阅读
罗布泊特殊的高温、干旱、高盐生态环境可能蕴藏着独特而丰富的微生物资源,也包括未知的新物种资源,这些微生物往往具有适应特殊环境的特殊生理特性,这为研究微生物多样性资源和微生物耐盐适应机制提供新途径和基因支持。本研究使用8种盐环境放线菌分离培养基,设置5个盐浓度梯度,采用稀释平板涂布法分离罗布泊土壤放线菌,并对发现的潜在新物种进行多相分类鉴定,揭示罗布泊地区放线菌物种多样性。选择2株分离自罗布泊的中度嗜盐放线菌进行四氢嘧啶合成基因簇的克隆与分析,筛选抗盐相关基因。1.罗布泊土壤放线菌多样研究从罗布泊地区共分离到放线菌317株,分属于16个属,60个种,其中,链霉菌属(Streptomyces)、拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)和普劳斯氏菌属(Prauserella)数量最多,还包括许多稀有放线菌,即拟无枝菌酸菌属(Amycolatopsis)、涅斯捷连科氏菌属(Nesterenkonia)、产丝菌属(Myceligenerans)多形态放线孢菌属(Actinopolymorpha)、嗜盐糖酶菌属(Haloglycomyces)、盐放线孢菌属(Haloactinospora)、放线多孢菌属(Actinopolyspora)、糖霉菌属(Glycomyces)、盐糖霉菌属(Haloglycomyces)、盐放线多孢菌属(Haloactinopolyspora)、糖单孢菌属(Saccharomonospora)、链单孢菌属(Streptomonospora)、考克氏菌属(Kocuria)和栖白蚁菌属(Isoptericola)。其中11株放线菌与亲缘关系最近的菌株的相似性<97%,可能代表新的分类单元。2.放线菌新物种的多相分类放线菌TRM 49117和TRM 49136代表着Glycomyces的二个新种,分别被命名为褐色糖霉菌(Glycomyces fuscus sp.nov.),模式菌株为TRM 49117T和白色糖霉菌(Glycomyces albus sp.nov.),模式菌株为TRM 49136Tr;放线菌TRM49201代表着Haloglycomyces 的一个新种,被命名为新疆嗜盐糖霉菌(Haloglycomyces xinjiangensis sp.nov.),模式菌株为TRM49201T。3.TRM 40136和TRM 45540四氢嘧啶合成相关基因簇的克隆与分析根据基因组测序结果,设计引物并扩增和分析2株中度嗜盐菌TRM 40136和TRM 45540四氢嘧啶合成相关基因簇。结果表明,TRM45540和TRM40136的四氢嘧啶合成相关基因可能为一个操纵子结构。TRM 45540四氢嘧啶合成相关基因ectABC全长为2403 bp,与已发表的四氢嘧啶合成相关基因编码的相关蛋白的一致性为93-98%;TRM 40136四氢嘧啶合成相关基因ectABC全长为2411 bp,与已发表的四氢嘧啶合成相关基因编码的相关蛋白的一致性为69-88%,可能是一个新基因。