各省各地区都把提高自主创新能力作为经济工作的重点，然而在实践中，首先遇到的问题是自主创新重点产业如何选择和制定什么样的政策支持重点产业的选择。本文通过梳理自主创新重点产业的选择机制，在理论上解决了自主创新重点产业的选择问题。全文共分为5部分。第1部分为绪论，描述研究背景，对自主创新重点产业选择机制的相关理论做了文献综述，并对本文中选取的指标和数据处理的方法进行了说明。第2部分分别介绍了自主创新重点产业市场和政府两种选择机制的内涵、特点及缺陷，以及协调机理。第3部分详细介绍了自主创新重点产业选择机制的协调过程，并提出了协调选择机制。这是本文的重点，协调选择机制在融合了市场和政府选择机制各自优点的同时，又避免了它们的缺陷。本部分强调了协调选择机制下政府作为协调人的作用，详细介绍了政策的协调方法及其协调效果。同时提出了协调方向选择体系。第4部分运用DEA工具分析了广州自主创新能力，在此基础上提出了自主创新重点产业和发展方向。最后，对本文的理论部分做了个总结，并根据理论研究提出政策建议。