块茎淀粉含量是衡量马铃薯（Solanum tuberosum L.）品质的重要性状之一。本研究以高淀粉四倍体马铃薯品系‘YSP-4’与低淀粉四倍体马铃薯品系‘MIN-021’杂交获得的F2代分离群体及28份马铃薯品种为材料,基于BSA分析技术,开发与马铃薯淀粉含量性状紧密连锁的SSR分子标记,并对其进行分析验证,在此基础上进一步筛选与其相关的候选基因。另外,从表型性状及分子标记方面对四倍体马铃薯品种进行遗传多样性分析,筛选适宜的杂交组合。本研究对分子标记辅助选育高淀粉且综合性状优良的四倍体马铃薯新品种具有重要意义。主要研究结果如下:1.利用亲本及F2代极端混池开发4个与马铃薯淀粉含量性状紧密连锁的SSR分子标记STG-200、STI-152、STI-174和STM-163。2.利用F2代分离群体对开发的高淀粉标记（STG-200、STI-152、STI-174）依次进行验证发现,在高、低淀粉材料中标记检测结果与淀粉含量测定结果吻合度分别达到了86.90%、78.57%和82.14%。标记与群体淀粉含量性状均达到极显著水平,相关系数（r）分别为0.624、0.525和0.621,表型方差（R~2）分别为38.4%、26.9%和38.1%。标记STG-200在28份四倍体品种中的检测结果与淀粉含量测定结果吻合度达到82.14%,相关系数为0.558,达到极显著水平,且表型变异解释率为28.5%。3.对标记STG-200、STI-152、STI-174和STM-163片段进行了回收、纯化、测序及BLASTn序列比对发现,标记STG-200与预测基因XM＿006357010.2的同源性高达94.12%。标记STI-152和STI-174与预测基因XM＿006348370.1的同源性分别为96.63%和98.04%。标记STM-163未比对到同源序列,可能涉及到一个新的基因。4.利用19个表型性状和8对SSR多态性引物对28份材料进行遗传多样性分析。表型性状UPGMA聚类分析表明,在欧式距离为8.08处,材料被聚成4大类群。分子标记UPGMA聚类分析结果显示,在欧式距离为0.69处,材料被聚成6大类群。