利用分子标记定位抗稻瘟病基因Pi-3

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该文采用STS分子标记G103和候选基因R14,以及利用CO39为遗传背景的近等基因系中的C104PKT和A57及其杂交后代为材料,开展了水稻稻瘟病抗性基因Pi-3分子定位研究.以R14为候选基因探针,分别与经XbaI酶切后的2个亲本、228个F<,2>代DNA样品进行分子杂交,结果表明R14在亲本中具多态性,在F<,2>群体中出现与抗病基因Pi-3共分离.以G103标记的序列设计引物G103R/F,对2个亲本、176个F<,2>代植株DNA样品进行STS扩增,再用内切酶EcoRV进行酶切,其酶切产物的带型与Pi-3提供的抗性共分离.其中标记R14与Pi-3间的卡平方值X<,R14>=1.50,标记G103的STS的扩增子与Pi-3间的卡平方X<,G103>=5.40,两个分子标记与Pi-3间均符合连锁遗传的概率值范围(卡平方X<,0.05>=5.99),而R14、G103均在第9染色体上,表明Pi-3亦位于第9染色体上,不是以前他人报道的第6或第12染色体上.该研究利用遗传统计作图软件Mapmaker/EXP对接种数据,STS分析与候选基因分析所得的数据进行统计分析,表明Pi-3位于探针R14与G103之间,与R14的遗传图距为1.7cM、与G103的遗传图距为6.2cM,首次绘制了Pi-3在第9染色体上的部分遗传图谱.
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