肠道微生物对动物的生理和健康状态至关重要。有研究显示,饮食、环境、日龄以及性别因素都可以影响肠道微生物的变化。其中,性别是否会对肠道菌群造成影响还没有统一的结论,阉割对于肠道微生物的影响也没有得到充分的研究。因此,针对相同饮食方式下不同性别海南特种野猪的肠道菌群进行研究非常有必要。本研究随机选择处于同一生长阶段的海南特种野猪30头,其中公猪、母猪以及阉猪各10头。所有野猪均采用相同的饲养方式。针对本研究主要进行了以下三部分实验:首先,通过16S r RNA基因测序技术对三组猪粪便微生物的丰富度以及多样性进行比较;然后,运用液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）对粪便进行代谢组学分析;最后,运用气相色谱法（GC）对粪便中的短链脂肪酸（SCFA）进行检测。16S rRNA基因测序结果显示,不同性别海南特种野猪粪便微生物的结构不同。母猪的粪便微生物丰富度以及多样性高于公猪,阉猪介于两者之间。在门分类水平上,公猪中Proteobacteria的丰度最高,阉猪中Actinobacteria的丰度最高,母猪中Bacteroidetes和Kiritimatiellaeota的丰度显著高于公猪以及阉猪;在科分类水平上,母猪中p-251-o5的丰度显著高于公猪和阉猪,Streptococcaceae在公猪中的丰度显著高于母猪和阉猪;在属分类水平上,Ruminococcaceae＿UCG-005在母猪中的丰度显著高于公猪和阉猪,Christensenellaceae＿R-7＿group在阉猪中的丰度高于公猪和母猪,而Streptococcus和Lactobacillus在公猪中的丰度最高。UPGMA分析表明,公猪和母猪样本分别单独聚类,部分阉猪样本与公猪聚类,部分与母猪聚类。液相色谱-质谱联用结果显示,不同性别海南特种野猪粪便的差异代谢物不同。公猪与阉猪组共检出625个差异代谢物,母猪与阉猪组共检出248个差异代谢物,公猪与母猪组共检出1060个差异代谢物。另外,公猪与阉猪组在正离子模式下不存在有显著差异的代谢通路,在负离子模式下存在有显著差异的代谢通路;其他两组在这两种模式下都存在有显著差异的代谢通路。气相色谱法结果显示,海南特种野猪粪便中的短链脂肪酸主要以乙酸和丙酸为主,异丁酸和戊酸含量较低。公猪的乙酸和丙酸含量显著高于母猪,阉猪介于两者之间。另外,除了阉猪中异丁酸的含量高于公猪和母猪外,其它3种短链脂肪酸的含量均为公猪最高、母猪最低,但是它们之间不存在显著性差异。这些结果表明,不同性别海南特种野猪的肠道菌群结构以及代谢产物有所不同。因此,性别会影响海南特种野猪的肠道菌群结构及代谢产物。