PLAG1及LTBP2基因突变与德州驴胸腰椎数目及体格形态的相关性研究

来源 :聊城大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:aig2008
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驴(Equus asinus)属于奇蹄目(Perssodactyla),马科,马属动物。我国地方驴品种资源丰富,拥有较好的抗逆性能的同时产肉、产皮性能均不突出,因而在24个主要地方驴品种基础上培育肉皮性能突出、适宜规模化养殖的新品种(系)具有重要的意义。德州驴是中国典型的大型驴品种之一,课题组前期屠宰试验发现德州驴存在胸腰椎数目变异现象,胸腰椎数目增加会带来家畜腰腹部的增长,进而带来产肉量及产皮量的增加。本文旨在研究(1)德州驴群体胸腰椎数目分布情况及由胸腰椎数目变异带来的体尺及屠宰性状的改变;(2)活体检测德州驴胸腰椎数目的仪器及方法;(3)PLAG1及LTBP2基因多态性是否与德州驴胸腰椎数目,体尺及屠宰性状相关。论文在山东省禹城市,东阿县,茌平县等多个德州驴养殖场采集了650头成年德州驴的胸腰椎数目及体尺性状,其中486头样本进行了屠宰试验,具有屠宰性状及血液样本,164头活体检测胸腰椎数目。使用所有样本分析了德州驴群体的胸腰椎数目分布情况及胸腰椎数目改变对体尺及屠宰性状的影响,对395头表型数据记录完整的德州驴样本进行PLAG1及LTBP2基因的多态性位点基因分型,构建单倍型并与胸腰椎数目,体尺及屠宰性状进行关联分析,寻找优势基因型及单倍型。研究结果如下:德州驴群体胸腰椎数、体尺及屠宰性状调查。观察到德州驴存在5种胸腰椎组合类型:T17L5,2.6%;T17L6,10.8%;T18L5,74.6%;T18L6,10.6%;T19L5,1.4%。增加一根胸腰椎,胸腰椎总长平均增长5.06 cm,体长平均增长1.97 cm,胴体重平均增加8.88 kg。24胸腰椎总数的T18L6和T19L5胸腰椎组合类型为最优胸腰椎组合类型。活体检测德州驴胸腰椎数目的仪器定制及应用。基于德州驴体尺数据及行为特征,定制出首台可移动式DR拍摄系统,可对不同生长阶段的德州驴精确检测出其胸腰椎数目,将具有24根胸腰椎数的驴选作种用,达到“定向培育多胸腰椎数德州驴新品系”的目的。德州驴PLAG1基因多态性与胸腰椎数,体尺和屠宰性状的关联分析。采用定向研发的GBTS液相芯片对PLAG1基因进行深度重测序,精准检测全基因范围内的变异位点,结果发现c.1-2627G>A与体高显著相关(P<0.05),GA基因型群体的体高显著高于GG基因型群体。德州驴LTBP2基因多态性与胸腰椎数,体尺性状和屠宰性状的关联分析。在我们用于分析的15个突变位点中,有5个SNVs与TN显著相关,12个SNVs与TL显著相关,1个SNV与STL显著相关,12个SNVs与LN显著相关,1个SNV与LL显著相关,12个SNVs与SLL显著相关,11个SNVs与TLN显著相关,12个SNVs与TLL显著相关,10个SNVs与STLL显著相关(P<0.05),不同位点与多个性状之间存在显著相关性。c.3410C>T和c.813-5759G>A对文中涉及的各个性状来说均为有害突变;c.1671+5985G>C对于多LN选育来说是有害突变,但是对于TN,CHC,CW等性状来说为有益突变;c.1671+7183C>T,c.1568+570G>T,c.1568+222C>T,c.1568+102A>C,c.1281+444G>A,c.813-2755A>C,c.813-4077C>A,c.813-7895A>G,c.813-8026C>T,c.813-9280T>C和c.813-9553T>G位点的突变对于LN来说为有益突变,对其他性状来说为有害突变。
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