乡镇作为我国最基层的一级政府，负有发展区域经济，直接领导农民致富，实践“三个代表”重要思想的历史重任。乡镇长的经济责任非常重大，其经济责任的履行情况关系到党和国家农村经济政策的执行，关系到农村的长远发展，农民生活水平的提高和农村社会稳定的大局。如何科学化地鉴定与评价乡镇长任期经济责任的履行情况，关系到乡镇长经济责任审计工作的全局。做出客观公正的审计综合评价，克服过去审计评价中存在的评价结论含糊不清、缺乏科学性的弊端，有效规避审计风险，提高审计质量和审计效率，对于乡镇长经济责任审计将有着重大的现实意义。由于社会制度的差异，国外并不存在类似中国特色的乡镇长经济责任审计，所以，本文首先回顾与总结了国外政府绩效审计的相关理论，在此基础上通过比较分析探讨了政府绩效审计与经济责任审计的相互关系及其对本文的启示。其次，根据国内大量相关文献的研究，结合现阶段乡镇长经济责任审计评价指标体系的研究现状，提出了乡镇财政财务、乡镇经济发展与经济责任目标完成、廉洁守纪、前瞻性四维度评价框架，共47项底层指标的三层评价体系。具体地来说，本研究的主要结论有以下几个方面：(1)首先通过村民访谈、专家咨询和Delphi法的应用，结合访谈研究结果，对指标进行筛选与修正，确立了25项评价指标。然后，再运用专家调查法和AHP层次分析法，确定主因素层及各项评价指标的权重值，构建了乡镇长经济责任审计评价体系。(2)在以上研究的基础上，运用方差分析对不同学历层次与工作年限样本的专家群体进行指标权重认定上的差异分析。研究表明，在现阶段的乡镇长经济责任审计环境下，专家们对指标的权重认定上存在较大的主观差异。本研究选取基于不同知识结构与工作年限的样本作为乡镇长经济责任审计评价指标体系的调查对象，可以更加全面地反映各方面对乡镇长经济责任审计的具体要求。(3)根据模糊综合评价原理，构建乡镇长经济责任审计综合评价模型，运用审计综合评价模型分别对A、B乡镇乡镇长的经济责任履行情况做出“三位一体”的定量审计评价，综合评价结果分别为90.23和75.15。再结合各维度的评价结果及A、B乡镇具体“镇情”的综合分析，显示了审计综合评价结果与A、B乡镇的实际情况是一致的，表明本研究乡镇长经济责任审计评价体系具有一定的科学性、效用性和可操作性。最后，本文在研究总结的基础上，指出了乡镇长经济责任审计评价指标体系研究这一新课题的未来研究展望。