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目的：了解黑龙江省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，MTB)北京家族菌株(Beijing family strains)的流行及耐药情况；建立适合本地区的MIRU-VNTR(mycobacterial interspersed repetitive units-variable-numbertandem repeat)基因分型方法，明确本地区流行MTB的基因型特征及传播能力。
方法：收集黑龙江省2007.5～2008.10临床确诊为结核病的住院病人分枝杆菌分离株共200株，全部菌株由哈尔滨胸科医院提供并经BACTEC-960全自动快速分枝杆菌培养鉴定系统进行培养、鉴定和一线药(异烟肼、利福平、链霉素和乙胺丁醇)耐药性测定。分离株经PCR方法鉴定为MTB。验证Spoligotyping和RD105缺失检测法鉴定北京家族菌株的一致性后，采用RD105缺失检测法确定本地区北京家族菌株比例，并根据RD105、RD181、RD150和RD142缺失情况区分亚型。选取19个MIRU-VNTR位点进行分离株基因型初步分析并进行位点优化；确定分型位点后测定全部MTB分离株MIRU-VNTR基因型，采用R2.9.1软件进行系统进化、分离株成簇能力分析；采用卡方检验分析北京家族菌株耐一线药特征及本地区MTB/耐药MTB成簇能力。
结果：经分子鉴定，全部分离株均为MTB；黑龙江省流行的MTB中，89.5％(179/200)为北京家族菌株，其中，亚型Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ的构成比例分别为6.1％(11/179)、92.7％(166/179)和1.1％(2/179)，无亚型Ⅳ菌株；发现三个新Spoligotypes，其中一个属于北京家族基因型；通过优化19个MIRU-VNTR位点，去除了ETR B、ETR C和MIRU23三个多态性低的位点；结果发现，15个位点的组合与16个位点的组合对菌株的分辨能力同样高(HGDI=0.9977，成簇率=10.0％)；其中10个位点的组合对菌株的分辨能力较高(HGDI=0.9950，成簇率=15.5％)；16位点分型结果中，200株MTB分离株属于180个基因型，分为四个基因群，北京家族菌株99.3％属于第Ⅳ群，其余0.7％分属于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ群(P<0.0001)；发现30个分离株为成簇菌株，成簇率10％；30株成簇菌株均分布于第Ⅳ基因群(P=0.0018)；且均为北京家族菌株，但与非北京家族菌株相比，其成簇能力无显著提高(OR，O；95％CI：0-1.0241；P=0.0869)；北京家族菌株和非北京家族菌株相比，耐药菌株比例无显著差异(OR，1.8771；95％CI：0.6828-5.2244；P=0.1670)，MDR菌株比例也无显著差异(OR，0.4.564；95％CI：0.0824-1.6670；P=0.2127)。
结论：黑龙江省流行的MTB中，89.5％为北京家族菌株，为本地区的优势流行菌株；其中，亚型Ⅱ菌株占92.7％，无亚型Ⅳ菌株流行。所选10个MIRU-VBTR位点组合对黑龙江省流行MTB有良好分辨能力，可用于大规模分子流行病学调查；15个MIRU-VNTR位点具有更高的分辨能力，可用于精确分析。黑龙江省流行MTB菌株的成簇率为10.0％(15个MIRU-VNTR位点)，低于世界和中国的其他地区，说明本地区的高耐药率与近期传播无关，为进一步探讨本地区MTB高耐药菌株比例形成的机制及制定合理治疗策略提供依据。北京家族菌株的优势流行与本地区MTB高耐药性和高MDR菌株比例无关，且未增加成簇能力；北京家族菌株不同亚型对一线抗结核药的耐药性无显著差异。