鼠疫是迄今为止仍广泛的活跃于世界各地的烈性传染病之一，我国幅员辽阔，菌种资源丰富，对各个地区菌株类型的了解和认识将有助于了解鼠疫菌菌株之间的相互关系。已经用于鼠疫菌的分型方法包括，限制性片段长度多态性方法(RFLP)，随机引物扩增多态性(RAPD)，串联重复序列多态性(VNTR)，脉冲场电泳(PFGE)，生态分型和生化分型等。本研究讨论的是以插入序列的位置对鼠疫菌进行分型。 插入序列是细菌中一种可移动的核酸序列，它在基因中以一定的频率发生转移，缺失和插入。同时，它介导的同源重组又会使基因发生水平转移的转位，或失活成为假基因。因为插入序列的位置具有一定的可变性，又有一定的稳定性，插入序列的研究方法可以指示菌株基因组的变化踪迹，直接反映基因组水平组成的状况。 本研究中使用的是鼠疫耶尔森菌的四个插入序列(IS1541，IS285，IS1661，IS100)之一的IS100。IS100以全部是完整拷贝的形式散布在整个鼠疫菌染色体DNA中，使一些基因成为假基因，并可以介导染色体DNA大片段的同源重组，使鼠疫菌的某些致病性发生改变，因此IS100的位置可以在某种程度上直接反映鼠疫菌的染色体DNA片段的组成，以及某些基因的存在状况。在此次研究中，用6个位置的IS100对来自13个生态型的97株鼠疫菌、1株EV菌和1株假结核耶尔森菌进行PCR扩增，通过分析得到了相应的分布，用以PCR扩增为基础的IS100基因分型是一种对鼠疫菌进行分型的可行方法。