本文以深圳股份合作公司为研究对象，以新制度经济学理论为主要分析工具，对伴随深圳城市化进程中产生的深圳股份合作公司的制度变迁路径、产权制度、治理结构、非正式制度进行了实证分析和理论探索，总结了深圳股份合作公司的制度缺陷，提出了促进股份合作公司进一步发展的设想和政策建议。具体内容包括： 第一，阐述了制度变迁的一般理论及制度变迁的影响因素；在分析深圳股份合作公司的发展历程和深圳城市化进程的基础上，指出城市化进程中出现的巨大“外部利润”是深圳股份合作制制度创新的动力；总结了深圳股份合作公司的现状。 第二，在阐述产权理论的基础上，简要实证描述了深圳股份合作公司的产权结构；分析了深圳股份合作公司在集体股、合作股等产权设置上的缺陷；指出土地使用权的垄断是股份合作公司产权制度缺陷的原因。 第三，分析的工具主要是委托代理理论和公司治理结构理论，并对深圳股份合作公司和一般的股份公司的治理结构进行了比较，在此基础上，对深圳股份合作公司治理结构进行分析，指出了其治理结构上的缺陷。第四，阐述了非正式制度对深圳股份合作公司发展的影响。第五，总结研究结论及提出深圳股份合作公司进一步发展的对策思考。比较系统地提出股份合作公司的制度缺陷，并提出深圳股份合作公司在产权制度、治理结构等方面进行创新的思路。