长豇豆耐冷种质资源筛选、遗传图谱构建及结荚期耐冷性QTL定位

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:z2901153
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低温冷害是我国长豇豆秋延后栽培和春提早栽培的主要影响因子。筛选培育耐冷的长豇豆种质资源是减少低温冷害的有效途径,开展长豇豆的耐冷性筛选及遗传理论研究具有重要的理论和实践意义。本研究以305份长豇豆种质资源进行结荚期耐冷性初步筛选,并进一步对初步筛选的50份材料进行萌芽期、幼苗期、成株期耐冷性综合评价,筛选到成株期和萌芽期耐冷亲本“迪拜豇豆”和冷敏感亲本“宁豇3号”进行杂交,利用2个亲本及杂交后代F1、F2、F2∶3世代进行耐冷相关性状的主基因+多基因遗传分析,用SLAP-seq测序技术构建长豇豆的高密度遗传图谱,对结荚期耐冷性进行QTL定位。结果表明:1.采用延后播种自然低温条件对秋季栽培的305份长豇豆种质资源耐冷性进行初步评估。305份材料被初步细分为6个类型,筛选到极耐冷材料1份,耐冷性较强的材料26份,冷敏感材料23份。发现我国主栽的长豇豆品种的耐冷特性与其在低温胁迫下的产量有相关性。2.利用主成分分析法、隶属函数分析法、聚类分析法和回归分析法对初步筛选的50份长豇豆材料的不同生长发育时期(萌芽期、幼苗期、成株期)的耐冷性进行综合评价,建立了长豇豆3个时期耐冷性综合评价数学模型。长豇豆萌芽期耐冷性评价的模型为D=-0.357+1.032*X2+0.404*X3+0.555*X6,确定了相对发芽指数(RGI)、相对发芽活力指数(RVI)、相对总鲜重(RFW)3个指标为萌芽期耐冷性的主要评价指标。筛选到萌芽期耐冷的长豇豆材料7份,冷敏感材料9份;长豇豆幼苗期耐冷性评价的模型为D=-1.853+1.145*X2+0.545*X3+0.537*X6+0.173*X7+0.113*X8+0.224*X9-0.099*X10-0.134*X12,筛选到了相对根数(RRN)、相对根长(RRL)、相对叶绿素总量(CT)、相对可溶性蛋白含量(SP)、相对可溶性糖含量(SS)、相对过氧化氢酶活性(CAT)、相对过氧化物酶活性(POD)、相对抗坏血酸过氧化物酶活性(APX)为幼苗期耐冷性评价的主要形态和生理学指标。获得幼苗期耐冷性极强的长豇豆种质2份,冷敏感长豇豆种质5份;长豇豆成株期耐冷性评价的模型为D=-0.481+0.210*X1+0.157*X3+0.494*X5+0.128*X10+0.178*X11,筛选到了耐冷指数(CRI)、相对单株产量(RYP)、相对豆荚长(RPL)、相对超氧化物歧化酶活性(SOD)、相对过氧化物酶活性(POD)可作为长豇豆成株期耐冷性评价的有效指标。获得了成株期耐冷性极强的长豇豆种质1份,耐冷性较强的长豇豆种质12份,冷敏感材料3份。3.分析了长豇豆不同时期耐冷性的相关性,发现成株期耐冷性与萌芽期呈显著正相关,成株期、萌芽期的耐冷性与幼苗期耐冷性无显著相关关系。成株期最耐冷的品种“迪拜豇豆”萌发期也表现较耐冷,但在苗期极不耐冷,成株期冷敏感的品种“宁豇3号”萌芽期也表现为冷敏感,但在苗期却表现为较耐冷。4.利用主基因+多基因遗传模型对长豇豆结荚期耐冷性相关性状进行遗传分析发现长豇豆冷害指数由2对加性主基因+加性-显性多基因(MX2-A-AD)控制,冷胁迫下单株结荚数由2对加性-显性-上位性主基因(2MG-ADI)控制,豆荚长和豆荚粗由1对加性-显性主基因+加性-显性-上位性多基因(MX1-AD-ADI)控制,在4个耐冷性相关的性状中均检测到了主基因的存在,耐低温性状在F2:3世代的主基因遗传率都比较高。5.首次应用SLAF-seq技术对长豇豆进行高密度遗传图谱的构建,构建了长豇豆的第一幅基于NGS(高通量测序)技术的图谱。由11个连锁群组成,包含5225个SNP标记,横跨1850.81cM,标记间平均距离为0.35cM,是迄今为止第二长的豇豆遗传图谱,密度远远高于基于GoldenGate平台的另外三幅SNP图谱。6.长豇豆与其他四种豆类(大豆、菜豆、绿豆和赤豆)的比较基因组分析结果表明长豇豆在遗传上与赤豆的亲缘关系更近。7.首次鉴定与长豇豆结荚期耐冷性相关的QTL,初步检测到了控制成株期耐冷性的QTL位点:qCTRS2和qCTRS10,分别位于连锁群2和连锁群10上,qCTRS2解释了10.74%的表型变异,该染色体区域有两个SNP标记,qCTRS10解释了13.67%的表型变异,该染色体区域有六个SNP标记。两个QTL都具有正向加性效应。
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