核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)是一种典型的死体营养型病原真菌,在世界范围内造成巨大的经济损失。菌核在核盘菌的生命周期和病害循环中作为一种休眠和存活结构,具有重要的生物学和生态学意义。micro RNA-like RNA(mil RNA)作为非编码small RNA的一种,在真菌的发育和致病性中起着重要的调控作用。真菌菌核的发育与复杂的生物学和生物化学调控相关。因此,本研究对参与核盘菌菌核发育的相关mil RNAs进行了研究。通过高通量测序、生物信息学分析和分子生物学等方法鉴定出275个在菌核发育过程中被诱导表达的候选mil RNAs,其中51个mil RNAs在菌核发育过程中显著差异表达。通过对显著差异表达mil RNAs调控靶基因的预测,并进行GO和KEGG功能分析注释。这些相关靶基因主要参与GO分析中的生物学过程、细胞成分和分子功能等,以及KEGG途径分析中的代谢、遗传信息和细胞等过程。此外,通过q RT-PCR检测了9个mil RNAs及其调控靶基因的表达水平,其中Ssc-mil R-240可能通过表观遗传调控其靶标组蛋白乙酰转移酶参与菌核发育,表明菌核发育可能与mil RNAs调控有关。本研究将有助于更好地解析核盘菌的菌核发育生物学及调控机制,为核盘菌及其他形成菌核真菌的发育调控及其引起的植物病害防控提供新的理论参考。