江西地区CRPA临床分离株的耐药和分子流行病学研究

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目的:1、分析耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌(Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa,CRPA)感染患者的临床特征,明确感染患者的死亡相关危险因素,为改善CRPA感染治疗效果提供有效的措施及建议。2、了解江西地区CRPA对各类抗菌药物的耐药现状和特征,为临床合理使用抗菌药物提供理论依据。3、分析江西地区CRPA菌株耐药基因携带情况,从而探讨其相关耐药机制。4、明确江西地区CRPA的基因分型及主要流行型别,分析江西地区CRPA流行特征。方法:1、自2018年9月至2020年12月,收集江西省11个地市11家三甲医院耐CRPA非重复临床分离株。所有菌株均经VITEK-II全自动微生物分析仪鉴定至种。2、收集CRPA感染患者的临床资料,回顾性分析CRPA感染患者的临床特征,采用单因素卡方检验和多因素logistic回归分析方法分析患者临床特征及预后相关危险因素。3、对亚胺培南、美罗培南、庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星、左氧氟沙星、环丙沙星、哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟、头孢他啶,氨曲南等11种抗菌药进行体外药物敏感性试验。4、通过聚合酶链式反应(PCR)检测CRPA相关耐药基因携带情况,脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型方法(Multilocus Sequence Typing,MLST)对CRPA菌株进行同源性分析。结果:1、临床感染特征:240名CRPA感染患者的平均年龄为56.73±16.71岁;主要为男性患者,占74.58%;科室分布情况:主要来源于ICU,占42.92%。240名患者中,30天内死亡患者32人,占13.33%。年龄?60岁、入住ICU和使用免疫抑制剂是CRPA感染患者死亡的独立危险因素。2、标本来源及药敏结果:240株CRPA的标本来源主要为痰液,占比72.92%。总体耐药情况:亚胺培南耐药率为92.5%,美罗培南耐药率为80.00%,除哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟、庆大霉素、妥布霉素、米卡星外,其他抗菌药物的耐药率均为30%以上。头孢他啶在不同年龄段的耐药率差异具有统计学意义(P<0.05),哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟、氨曲南、庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星、环丙沙星、左氧氟沙星在不同地区间的差异具有统计学意义(P(27)0.05),且均以中部地区耐药率最高,东部地区耐药率最低。3、240株CRPA菌株中,膜孔蛋白Opr D2基因缺失率为56.67%(136株);?-内酰胺酶基因中TEM、PER、GES、OXA-10基因的检出率分别为0.83%(2株)、0.42%(1株)、13.75%(33株)、0.42%(1株),VEB基因无阳性结果检出;金属?-内酰胺酶基因中VIM、GIM检出率分别为16.25%(39株)、0.83%(2株),IMP、SIM基因无阳性结果检出。4、PFGE结果显示240株CRPA可分为1-36型36种聚类组,主要聚类组是7型、12型和1型;MLST结果显示有43种ST型,优势克隆型别为ST235、ST244、ST773、ST381和ST274;存在7组较大菌株关联密切的序列组(STs)。结论1、研究发现年龄?60岁、使用免疫抑制剂和入住ICU是影响CRPA感染患者死亡的独立危险因素,故应将需要使用免疫抑制剂和入住ICU且年龄?60岁的患者作为CRPA感染的重点防控对象。2、240株CRPA菌株中,对其各种抗菌药物存在不同程度的耐药,且耐药情况严重。各地区之间耐药情况存在差异,性别和年龄对于菌株耐药在统计学上差异无意义。3、本研究结果显示有56.67%的CRPA菌株Opr D2基因存在缺失,这说明江西地区CRPA菌株对碳青霉烯类抗生素耐药的主要原因之一是Opr D2基因的缺失。4、江西地区CRPA菌株ST型别分布较为分散,ST235为江西地区CRPA菌株的主要优势流行克隆型,ST344为次要优势流行克隆型,有7种关联密切的ST型序列组(STs)。
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