巴马拟缨鱼（Pseudocrossocheilus bamaensis）隶属于鲤形目（Cyprinformes）鲤科（Cyprinidae）野鲮亚科（Labeoninae）拟缨鱼属（Pseudocrossocheilus）,主要分布在我国珠江水系红水河,常见于广西区内的天峨、巴马、大化和都安等地,在贵州的平塘和罗甸也偶有分布,是一种小型土著名优经济鱼类。随着人们消费水平的提高,巴马拟缨鱼市场需求量越来越大。在尚未完全实现其规模化人工繁育的情况下,近年来的酷渔滥捕已造成了该物种自然资源的严重退化,急需对其种质资源进行系统调查与评估。本研究采用形态学和遗传学研究方法,详细比较了该物种不同地理群体以及3龄雌雄样本的形态差异,对影响3龄雌雄样本体质量的关键形态指标进行了科学评估,并通过线粒体D-loop区分析了不同地理群体遗传多样性和遗传结构,结合相关资料推测和解析了其当前地理分布格局的形成机制,旨在为巴马拟缨鱼种质资源保护和合理开发利用提供理论依据。1、巴马拟缨鱼群体形态差异分析本研究结合传统形态学和框架形态学对8个地理群体的巴马拟缨鱼样本进行了多元统计分析。主成分分析共提取了9个主成分（PCA1～PCA9）,其中前3个主成分贡献率较高,主要反映了鱼体头部、尾部及背腹部的形态变化。PCA1和PCA2散点图显示,部分地理群体已能明显区分,各群体在PCA1轴上的差异较在PCA2轴上的差异更为显著;经逐步判别分析筛选出的18项标准化性状参数对各地理群体判别准确率在89.06～97.67%之间,综合判别准确率为92.83%,能对各群体进行较好区分;聚类分析结果显示,各地理群体大体可聚集为3支,其中东兰、大化、天峨和合山4个群体先聚为第一分支,接着与第二分支中的平塘、罗甸和巴马3个群体聚类,最后才与第三分支中的都安群体聚到一起;差异系数计算结果表明,除巴马群体外,其它各群体在标准化性状参数上均体现出亚种分化情况,但群体间形态分化方向不具有一致性,且相邻群体间亦不存在形态上的亚种分化,因此判断巴马拟缨鱼不存在亚种。此外,从主成分散点图和聚类分析结果中均发现各群体间形态距离与地理分布远近不具有明显一致性,推测可能与巴马拟缨鱼在形态上对局域环境变化较为敏感而产生了趋异演化有关。2、巴马拟缨鱼雌雄形态差异分析及可量性状和体质量关系探讨本研究以3龄巴马拟缨鱼雌雄个体为研究对象,进行了以多元统计分析为基础的传统形态学和框架形态学比较。主成分散点图显示雌雄间形态差异主要体现在鱼体腹部特征（PCA2）上;经逐步判别分析建立的3龄巴马拟缨鱼性别判别方程对2龄、3龄、4龄及4龄以上雌雄样本进行较好区分;通过统计3龄雌雄样本各生长性状参数发现巴马拟缨鱼雌性体型明显大于雄性,并推测可能与其野外成熟的雄性个体较少导致生殖耗能较多,以及雌性的生育力选择进化等因素有关。探讨3龄巴马拟缨鱼雌雄个体的14项可量性状和体质量关系发现,影响雄性体质量的关键性状参数为全长、体厚和体高,雌性的为全长、体厚、体高、躯干长和尾柄高,影响雌雄体质量的关键性状参数有所不同,建议在后续良种选育过程中按性别对其进行分类选择。3、巴马拟缨鱼群体遗传学研究基于巴马拟缨鱼线粒体D-loop区全长（942 bp）对8个地理群体进行遗传学分析,共检测出23个单倍型,群体单倍型多样性（h）为0.672,核苷酸多样性（π）为0.0012,整体遗传多样性水平偏低。各群体中遗传多样性水平较高的有天峨（h=0.870,π=0.0022）、罗甸（h=0.705,π=0.0009）和大化（h=0.660,π=0.0005）,较低的为东兰（h=0.239,π=0.0001）、平塘（h=0.123,π=0.0001）和巴马（h=0.213,π=0.0000）。此外,巴马拟缨鱼群体间遗传分化指数（Fst）在-0.02596～0.94204之间,遗传距离变化范围为0.0000～0.0037,平均核苷酸差异数(Kxy)范围为0.393～5.182,由这3项遗传学参数以及群体间基因流（Nm）、确切P检验和单倍型系统发育树均可做出推论:即巴马拟缨鱼按地理分布可划分为两大支系,红水河上游的平塘、罗甸和天峨3个地理群体为一支,中下游的东兰、巴马、大化、都安和合山5个地理群体为另一支系。两支系间以及上游的平塘群体和罗甸、天峨2群体间均存在较大遗传分化,下游的5个地理群体间遗传分化较小。将2个支系进行分子方差分析（AMOVA）发现,巴马拟缨鱼群体间遗传分化主要来源于水系中的不同地理区间以及地理区间内的各群体间。单倍型网络图表现出明显的与地理分布相对应的谱系结构,根据网络图推断出该物种的祖先单倍型为HAP1和HAP2,结合各群体核苷酸多样性（π）推测出其祖先发源地可能为广西壮族自治区的天峨县。Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验结果则提示巴马拟缨鱼经历过近期的群体扩张事件。基于数量和空间扩张模型,红水河上游群体的核苷酸不配对分布曲线均呈明显单峰,推算其在大约58,000年前经历过栖息地扩张,约46,000年经历过数量扩张;而中下游群体的核苷酸不对称分布曲线拟合效果较差,但基于空间扩张模型的核苷酸不配对分布中平方偏差之和与粗糙指数值均不显著,推测其在距今21,000年左右亦发生过栖息地扩张事件。综上,巴马拟缨鱼多数地理群体呈现出低h和低π现象,这可能与该物种迁徙时间距今较短以及各群体近期承受的较大生存压力有关,建议应根据不同采样点资源现状及水系分布情况进行科学管控和利用。