1例携带NUP107变异的原发性闭经合并高血压病例分析及文献复习

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研究背景:根据不同致病因素,原发性闭经可被分为子宫及生殖道病变所致、卵巢病变所致、垂体病变所致、下丘脑病变所致、其他内分泌疾病和生理性青春期延迟所致的原发性闭经。其中,卵巢病变中的卵巢早衰是由多种原因引起的原发性卵巢缺陷,表现为月经初潮缺失或40岁前卵泡衰竭/卵泡发育停止。高血压是全世界死亡和残疾的主要独立威胁因素,也是心脏疾病、慢性肾脏疾病和认知功能障碍最常见的可预防危险因素。约90-95%的高血压患者为原发性高血压,其不仅可由染色体基因变异引起,还可能与线粒体基因组相关。随着基因诊断技术的发展,越来越多与高血压相关的、由基因变异引起的罕见疾病得到了合理的诊治。NUP107的结构于1994年被首次发现,其作为核孔复合体的关键组成部分,参与双向核质运输和有丝分裂器的组成。NUP107前期被报道与卵巢功能紧密相关,但尚无报道提示NUP107基因变异可导致原发性闭经合并高血压。研究目的:本研究旨在结合文献阅读和病例分析对原发性闭经、高血压、NUP107基因之间的关系进行探讨,以促进疾病的早期诊断与治疗,为进一步研究该基因与疾病的关系和基因诊断罕见病提供支持。研究方法:收集报告2020年7月山东大学附属省立医院内分泌科收治的1例卵巢早衰合并原发性高血压患者的完整临床资料。在获取知情同意后,从患者及家属共6名个体中分别获得2-3ml外周血样本并从中提取出基因组DNA备用。对患者的基因组DNA进行了全外显子组测序,包含人类全部基因20099的外显子区域和相邻内含子区域(50bp)。依据《序列变异解读标准和指南》评估筛选后的变异致病性,并采用人类基因组变异学会的命名法对其进行分类。当在常染色体隐性基因中检测到致病性或疑似致病性变异时,通过新一代测序和/或Sanger测序验证,以确保对该基因编码序列的覆盖率达到100%。除此之外,根据先证者的变异位点,对其余5位个体相应区域的外显子和旁侧内含子区域进行了 Sanger测序,以验证是否存在变异。最后,为进一步探究NUP107基因与疾病的关系,对GEO数据库中未处理的DLD-1细胞和敲除NUP107基因的DLD-1细胞转录组测序结果进行了生物信息学分析。结果:患者出院后坚持使用降压药物和人工周期疗法,仍无自主月经来潮,收缩压控制在160mmHg左右,未再出现上述不适症状,目前仍在随访中。患者NUP107基因存在2个杂合变异位点,均为常染色体隐性遗传,分别是无义变异c.709G>T(p.E237X)和错义变异c.1063C>T(p.R355C)。其父亲和祖父携带杂合变异c.709G>T,其母亲携带杂合变异c.1063C>T,而其祖母和弟弟未携带以上变异。c.709G>T无相关报道,其会导致编码蛋白的异常翻译和提前终止,可能影响编码蛋白产物的功能,被定义为疑似致病性变异。c.1063C>T曾被报道与卵巢早衰有关,发生频率为T=0.000021,生物信息分析软件预测其可能致病,被定义为具有临床不确定意义的变异。GSM3937080-82组(敲除NUP107的DLD-1细胞的转录组测序数据)对比GSM5213038-40组(未处理的DLD-1细胞的转录组测序数据)共筛选出1026个差异基因,主要富集的20个通路中包括blood vessel development、growth factor activity、positive regulation of reproductive process 等通路。结论:1.报道了一例携带NUP107复合杂合变异的原发性闭经合并高血压的21岁病例,患者最终被诊断为卵巢早衰和原因不明的早发顽固性高血压。2.生物信息学分析提示 NUP107 与 blood vessel development、growth factor activity、positive regulation of reproductive process 等通路可能关联密切,猜测NUP107基因变异可能与高血压和原发性闭经的发生有关。3.NUP107 基因(c.709G>T,p.E237X)和(c.1063C>T,pR355C)复合杂合变异可能是本例患者卵巢早衰的原因。
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