创新是解决区域发展中资源有限性与需求无限性矛盾的关键。2015年以来,我国发展模式逐渐转为以创新为中心的理念,创新产出已经成为衡量区域竞争优势不可或缺的因素,由要素和投资驱动向创新驱动转变的速度开始加快。而区域创新产出的数量和质量,往往受到空间范围内创新主体（如企业、高校、科研机构）协同、创新资源（如资金、知识、技术、人才等）流动和创新环境的影响。一方面,创新主体间既存在协同共生关系,也存在竞争关系,另一方面本地区的创新活动还会受关联地区的影响,各个区域并非封闭的独立系统。因此,在各类创新要素复杂融合的经济背景下,创新生态系统理论作为在创新集群理论和创新系统理论基础上提出的最新研究成果,侧重创新主体在复杂多变的创新环境下通过开放式协同创新的方式,利用区域内外创新资源应对外部环境的冲击,系统具有恢复系统平衡稳定力的区域韧性,更适合用来整体揭示区域在空间范围内的协同创新行为对创新产出的影响机制。由于系统内若干创新主体的协同创新行为是在不同社会、经济等环境下对区域创新产出产生影响,不同环境下的社会过滤也将导致协同创新活动的成果转化。目前,创新生态系统理论主要应用于企业层面的研究,从区域层面考察协同创新活动影响创新产出的研究仍是相对匮乏。因此,从创新生态系统视角分析区域协同创新行为对创新产出的影响机制显得有必要性。经济圈是由若干城市依托于一定的社会经济环境,通过空间关联形成的区域,所形成的协同创新集群是国家整体创新产出的驱动力。2021年2月,成渝地区双城经济圈成为西部地区关键发展点,被列入九大国家级经济圈之一,但成都及重庆比其他邻近市区（县）相对资源较为丰富,区域间协同互动发展尚未平衡,导致区域创新生态系统体系不明显,互联互通的发展模式尚未形成。当前国内学者主要以京津冀等已形成较完善创新生态系统体系的经济圈作为研究对象,较少对成渝地区等后发型经济圈的针对性研究。因此本文选取成渝地区双城经济圈的32座城市,在创新生态系统建设的视角下,系统考察区域空间范围内的协同创新行为对创新产出的影响及两者关系的内在机理。基于创新生态系统理论及过往学者的相关研究,本文剖析空间关联效应下协同创新对区域创新产出影响的内在机理,从而试图为我国区域创新产出和成渝地区双城经济圈的创新产出提升提供具有一定意义的思路与对策。研究首先以创新生态系统理论为理论基础,对涉及到的变量进行文献综述及逻辑梳理,并设计了区域内及区域之间的创新生态系统模型。然后,构建协同创新、区域创新产出、区域韧性和社会过滤四个变量之间的概念模型,并列出三组研究假设。其次,根据2021年规划建设中涉及的四川省15个市,重庆市27个区（县）及开州、云阳部分地区,剔除缺失协同创新数据的12个市区（县）,考虑到2013年以前部分指标数据还未统计,故将32个市区（县）数据时间范围选取在2013年至2019年。本文运用stata15.1及Geoda095i软件进行区域地理距离测量及基于R＆D人员流动距离权重下的空间关联性计算,验证成渝地区双城经济圈的空间关联效应是否存在。在证明空间关联效应存在的前提下,再进行空间计量回归分析,完成对主效应、中介效应和调节效应的检验。实证检验结果如下:1)成渝地区双城经济圈各区域间存在空间关联效应并显著正向影响区域创新产出;2)空间关联效应下的协同创新显著正向影响区域创新产出;3)区域韧性部分中介空间关联效应下协同创新与创新产出的关系;4)社会过滤显著负向调节空间关联效应下协同创新与区域韧性的关系。本文从创新生态系统视角出发,揭示了区域层面上存在空间关联的协同创新对创新产出影响作用的中介路径及边界条件,结论对成渝地区双城经济圈进一步提升创新产出具有重要的现实意义和理论意义,并为国内其他城市群或经济圈创新建设提供参考。