【摘 要】
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目的:本研究旨在通过高通量测序的方法探讨哮喘合并过敏性鼻炎患者(CARAS)转录调控的基因表达特征,探寻miRNA/mRNA调控模式在CARAS发病机制中的作用。材料和方法:应用高通量
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目的:本研究旨在通过高通量测序的方法探讨哮喘合并过敏性鼻炎患者(CARAS)转录调控的基因表达特征,探寻miRNA/mRNA调控模式在CARAS发病机制中的作用。材料和方法:应用高通量测序方法对3例哮喘合并鼻炎(CARAS)患者、3例鼻炎患者及3例正常对照组的血液标本进行RNA序列检测;将我们测得的高通量测序结果分别通过cuffdiff软件以及miRDeep2、DEGse软件与已发表的高通量表达数据进行整合,分析基因和miRNA的表达定量和差异表达结果,P值<0.01和FDR<0.001被认为有统计学意义;构建miRNA与基因间的靶向分析,对获得的差异表达的miRNA靶基因应用基因本体数据库(GO)与《京都基因与基因组百科全书》(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG数据库)进行富集分析,评价基因的生物学功能,p<0.05被认为有统计学意义。结果:对哮喘vs鼻炎组,鼻炎vs对照组分别做靶向分析,寻找靶向且负相关的基因。其中,哮喘vs鼻炎组有159个差异表达基因(DEGs)和39个miRNA;鼻炎vs对照组有2685个DEGs和88个miRNA。将两组共同分析后,得到既和鼻炎相关,又和哮喘相关的mRNA52个,miRNA16个。富集分析表明:基因SLC14A1、SNCA、TNS1、KAT2B、PARP1表达水平由hsa-miR-93-5p、hsa-miR-92a-3-p和hsa-miR-21-5-p所调控。此外,吞噬体通路是唯一显著富集的信号通路,涉及基因为HLA-DOA,TUBB2A和MRC2,其P值为0.006。结论:miRNAs调控下的基因表达紊乱可能在CARAS患者发病过程中起着重要的作用。
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