青藏高原东南缘由于特殊的生态地理条件，拥有丰富的森林资源，这些资源是长江上游涵养水源、保持水土的生态屏障，是生物多样性的资源宝库。但随着过量的森林采伐，使该区曾经丰富的生物多样性资源遭受了前所未有的破坏，天然林的质量严重下降，生态系统退化，功能减弱。与此同时，许多物种的种群规模正在锐减，物种的遗传多样性也严重丧失。川西云杉是西部地区分布最广的云杉树种之一，在较高海拔的地区有着重要的生态学功能，是一种适应性很强的乡土树种。本项目采用简单序列重复标记(SSR)和特定序列位点(STS)研究不同生境条件下川西云杉群体的遗传变异及其时空分布格局，考察遗传变异与复杂的山地生态环境间的潜在联系，系统地揭示川西云杉天然群体与环境系统相互作用的生态适应与分子进化机制。研究成果能有效地为该树种遗传资源的科学保护与合理利用提供理论依据和科学指导，可为中国西南部亚高山天然林的可持续经营及退化生态系统的恢复与重建提供依据。主要研究结果如下：　　 1.STS和SSR两种分子标记的研究结果表明：川西云杉群体拥有中等水平的遗传多样性(基于SSR标记，平均He=0.640；基于STS标记，平均He=0.553)。造成这种中等水平的遗传多样性，可能是由于历史原因，川西云杉天然林被大量采伐，导致了遗传多样性的丧失。两种方法都检测出群体BT有着最高水平的遗传多样性。　　 2.两种标记的结果都一致说明：检测的10个川西云杉群体间遗传分化比较高，其存在群体间的遗传变异比例要明显地高于广泛分布的挪威云杉、横贯大陆的黑云杉以及兼有连续分布和不连续分布的西加云杉等，但要低于分布范围狭窄且呈不连续分布的粗枝云杉。青藏高原东南部的片段化生境可能是导致高水平遗化的主要原因。　　 3.基于两种标记的UPGMA聚类和PCA分析结果，以及基于SSR标记的FCA分析结果都显示：群体BY遗传上明显区别于其它群体，其可能原因是青藏高原东南缘山脉阻隔而导致的生殖隔离的结果。　　 4.根据软件Bottleneck1.2.02的检测以及不依赖哈迪—温伯格平衡的M比率检测结果：川西云杉种群很有可能经历了近期的遗传瓶颈效应。在本研究中遗传瓶颈效应并没有显著影响到物种的遗传多样性。然而，在这些片断化群体未来的子代群体中很可能出现遗传瓶颈导致的遗传多样性下降的效应。