目的：本次研究的目的是围绕当前卫生改革与发展目标和重点，深入了解和系统分析新疆各级疾病预防控制机构人力资源、经费保障、基础设施、科研能力、检验能力等方面的建设情况，对机构的能力建设情况进行一个全面、合理地综合评价，探讨和总结体系建设过程中所取得的成绩和经验，找出存在的主要问题及其原因，为进一步完善疾病预防控制体系建设和机构转型提供理论依据，也为今后疾病预防控制机构能力建设提供循证依据。方法：整个研究工作以事实为依据，大量借用统计学、流行病学、经济学、社会学等多学科的理论和方法，并咨询了一些专家和疾病预防工作者的意见。本课题主要采用文献研究、专家咨询、比较研究等方法。调查资料收集后，进行数据核查，建立EXCEL数据库录入数据，并对数据进行二次核对，保证数据完整性、准确性和真实性。结果：本研究的研究结果主要包括：（1）人力资源：全疆疾病预防控制体系在岗人员主要以卫生技术人员为主，新疆三级机构卫生技术人员比例分别为61.6%、77.9%、77.8%，与国家建议标准有一定的差距（23.4%、7.1%、7.2%），本科及以上学历人员比例仍旧偏低，与国家规定分别有2.2%、19.4%和15.9%的差距，其中地市级机构的差距最大且地市级和县级机构的高级职称人员偏少，中级和初级职称人员比例偏多。疾病预防控制体系人员结构需要全方位的调整补充。全疆疾病预防控制人员年龄水平集中在35岁到50岁之间。（2）经费保障：由于财政投入不足，导致部分公共职能偏废，重有偿轻无常，收支部分不平衡，出现支出超过收入现象。（3）基础设施：病预防控制机构工作用房由业务用房、实验用房、保障用房和行政用房等组成。全疆总体来看，这四种工作用房所占比例平均为40.8%、29.5%、30.3%和10.8%。为确保疾病预防控制体系职能的有效发挥，疾病预防控制体系的建设标准是实验用房所占比例最大，其次是业务和保障用房，行政用房最低。新疆的实际情况是，全疆各级疾病预防控制机构都是业务用房所占比例最大，其次是保障用房，实验用房，行政用房也占了不少的比例。（4）检验能力：全疆三级疾病预防控制机构没有一个符合国家标准，地市级机构的检验能力与国标相比差距最大。（5）科研能力：新疆各级疾病预防控制机构中自治区疾病预防控制机构承担的科研项目和发表的论文数无论在级别上还是在数量上均处于较高的水平，而地市级和区县级机构虽然承也担着一定的科研，但是有能力的科研项目确很少。（6）综合评价：采用主成分分析法实现了对全疆14个地（州、市）和94个县（区）疾病预防控制机构的服务能力综合评价，得出了排名顺序。结论：疾病预防控制体系建设是一项系统工程，能力建设(包括人力、技术、设备条件等)才是疾病预防控制体系建设重点，目前新疆疾病预防控制体系人力、财力、物力、检验、科研能力等仍然存在着不足，与国家要求仍有差距，全疆疾病预防控制体系建设任务依然任重道远。