鸡GLUT4基因可变剪切体鉴定与主要转录本的功能分析

被引量 : 0次 | 上传用户:guomeixiang
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
在哺乳动物中,葡萄糖转运蛋白4(GLUT4)在调节葡萄糖摄取中发挥着重要作用。到目前为止,对GLUT4的研究主要集中在哺乳动物,而对鸡GLUT4的研究很少。本试验根据NCBI提供的预测序列,对鸡GLUT4基因进行全长扩增,对所获序列进行生物信息学分析,并采用RT-qPCR对GLUT4的时空表达特性进行研究;之后在体内体外分别探索鸡GLUT4对外源刺激的响应;最后在细胞水平过表达GLUT4,探究GLUT4基因对鸡骨骼肌细胞增殖、分化、凋亡和葡萄糖摄取的影响,并利用RNA-seq,进一步探究GLUT4基因发挥功能的作用机制。试验一鸡GLUT4基因的克隆、序列分析及表达特征研究为探索鸡GLUT4基因的序列特征和表达特性,本试验通过常规PCR扩增、5′-RACE和3′-RACE获得了鸡GLUT4基因序列,并对其基因组结构、剪接模式、亚细胞定位预测和同源性进行分析。此外,采用RT-qPCR方法检测了14胚龄(E14)、19胚龄、7日龄(D7)、D21和D49的鸡肝脏和横纹肌(心肌、胸肌和腿肌)中GLUT4的分布。结果显示,鸡GLUT4基因至少产生14个转录本(Gen Bank登录号:OP491293-OP491306),编码12种氨基酸序列(长度在65-519个氨基酸之间),预测具有明显不同的亚细胞定位。这些蛋白含有典型的MFS结构域。主要转录本(命名为T1)由11个外显子组成,编码519个氨基酸。此外,对鸡GLUT4基因表达的时空分析表明,鸡GLUT4基因主要在横纹肌中表达,并且鸡GLUT4基因在心肌、胸肌和腿肌中的表达水平随鸡的发育而显著波动。这些数据表明,鸡GLUT4经历了复杂的选择性剪接事件,并且GLUT4在横纹肌中的表达水平在不同发育阶段受到动态调节。试验二外源刺激对鸡GLUT4基因表达的影响为探索鸡GLUT4对外源刺激的响应,本试验通过体内体外分别进行。在体内试验中,分别利用5 IU/kg的胰岛素溶液、2 g/kg的10%葡萄糖溶液、2 g/kg的丙酮酸钠溶液、30%能量限饲、15%能量限饲、15%蛋白限饲、禁食等外源刺激,检测GLUT4在胰岛素敏感组织中的mRNA水平的表达情况。体外试验中,分别在成肌细胞或卫星细胞中进行外源胰岛素、葡萄糖、饥饿处理。结果表明,在体内试验中,胰岛素、丙酮酸钠、限饲处理均没有显著改变所检测组织中GLUT4的表达量。葡萄糖处理60 min时,GLUT4表达量相较于生理盐水对照组显著降低(P<0.05)。鸡GLUT4在禁食组的表达量要显著低于对照组(P<0.05)。在成肌或卫星细胞,低浓度的胰岛素或葡萄糖处理可上调GLUT4表达;血清饥饿18 h可以显著增加成肌细胞中GLUT4的表达(P<0.05)。试验三鸡GLUT4主要转录本在骨骼肌细胞中的功能鉴定为探索GLUT4基因对鸡骨骼肌细胞增殖、分化、凋亡和葡萄糖摄取的影响,本试验以鸡成肌细胞或卫星细胞为研究对象,利用RT-qPCR技术检测肌细胞增殖分化过程中GLUT4基因的表达规律。运用脂质体转染技术,对GLUT4进行过表达,分析GLUT4对成肌细胞或卫星细胞增殖、分化、凋亡和葡萄糖摄取的生物学效应。最后进行RNA-seq,以进一步探究GLUT4基因发挥相应功能的作用途径。结果显示:GLUT4在鸡成肌细胞和卫星细胞的增殖期和分化期的表达量均存在差异,在分化期的表达量低于增殖期(P<0.05)。过表达GLUT4后,利用RT-qPCR技术、CCK-8、EDU试验,发现过表达GLUT4可以促进鸡肌细胞的增殖与分化,抑制细胞凋亡;利用葡萄糖摄取试验和对细胞培养液中葡萄糖含量测定试验,发现过表达GLUT4能促进葡萄糖摄取。在鸡骨骼肌卫星细胞中过表达GLUT4 48 h,并将过表达组和对照组细胞进行RNA-seq,共获得302个差异表达基因,主要富集于线粒体、呼吸链、跨膜转运蛋白活性和钙离子结合等GO条目。KEGG富集分析发现差异表达基因主要富集于氧化磷酸化、核糖体、心肌收缩和细胞色素P450对异种生物的代谢等信号通路,表明GLUT4可能通过调节线粒体相关基因调控细胞葡萄糖摄取进而促进细胞增殖和分化,抑制细胞凋亡。
其他文献
金融科技作为数字科技与金融传统业务的创新性产物,不仅革新了传统金融业务模式,更潜移默化地改变着企业的经营模式与生产方式。由于金融科技具有覆盖面广、覆盖程度深、用户粘性强的特点,各大金融机构都在自身原有的优势基础上,将自身业务与新型技术相结合构建出金融科技类业务,为企业提供更加便捷高效的借贷服务、投融资服务、金融咨询服务等;数字化转型是企业实现业务突破的重点方向,对企业提升自身生产效率、降低成本、提
学位
棉花是世界上最重要的天然纺织纤维作物,全球每年纤维总需求的约35%由棉花纤维提供。棉花纤维是起源于胚珠表皮的单细胞,其发育历经起始、伸长、次生壁生物合成和成熟4个阶段。赤霉素(GA)是一种重要的植物激素,在整个植物生命周期中调节各种生长发育过程。GA对棉花纤维发育有着深远的影响。例如提高棉花纤维中的GA水平可以增加成熟纤维的长度以及纤维细胞壁厚度。近些年来,虽然有许多研究者从不同角度去解析GA调控
学位
钱中文作为中国文论界的重要人物,从上世纪八十年代起至今仍活跃在学界前沿,本文将从钱中文对于民族文学的研究出发,指出其对民族文学问题持续保持的极高关注度,并阐明其关于民族文学的主要理论思想,寻找他的民族文学观与他的文学理论体系之间的内在联系。论文分为四个章节:第一章是钱中文民族文学观的理论基础。本文在对民族文学概念进行说明的基础上,阐明钱中文关于民族文学的界定范围,并从审美反映论的角度探讨民族文学的
学位
近年来,随着无线通信用户数量的急剧增长,5G(Fifth Generation)网络已经成为实现万物互联的共同选择。5G移动通信的三大应用场景分别为:增强型移动宽带、海量机器通信和高可靠低延时通信(Ultra-Reliable and Low-Latency Communications,URLLC)。目前,短包通信、智能反射面(Intelligent Reflecting Surface,IRS
学位
随着高速铁路通信技术的发展,人们对铁路无线通信需求从传统的语音业务发展到现今的高数据速率业务,例如面向乘客的移动电视、互联网应用等通信业务。然而,高铁无线通信仍面临着许多挑战,包括复杂的电磁传播环境、频繁的越区切换、高多普勒频偏、车辆穿透损耗以及用户集中导致的信令风暴等。为了满足新型通信业务的需求并同时保证列车运行的安全性和高效性,需要对现有的高铁通信技术进行深入研究,并探索适用于未来超高速场景下
学位
在深度学习中,“预训练+微调”范式是经典的模型领域适配技术,可有效将预训练模型的丰富知识迁移至新的任务中。然而,随着深度神经网络的规模不断增大,生成式大模型的参数规模往往动辄数十亿甚至数千亿。因此,本文指出在新任务中“全量微调”生成式大模型以实现领域适配不再具有可行性。接着,针对以上问题,本文介绍了一种“轻量化”的大模型领域适配技术——高效参数微调,并对三类主流算法进行综述,分析了算法的主要思想和
期刊
随着智能生成技术的不断发展与应用,手语数字人技术的应用场景也在不断扩大。智能生成技术可以将文本、语音等不同形式的信息转化为手语数字人的形式,为聋哑人士提供更加多样化和便捷的交流方式。此外,智能生成技术还可以通过机器学习和人工智能算法不断优化手语识别和生成的准确性与速度,提高手语数字人技术的用户体验和应用效果。本文将从人工智能的发展历程出发,详细介绍基于智能生成技术的手语数字人发展现状、所遇到的挑战
期刊
高速铁路是一种重要的国家交通基础设施。近些年来,我国高速铁路设施发展迅速,技术水平居于世界前列。现在,高铁已经成为了很多人首选的出行交通工具,然而,高速铁路系统与列车用户增长的流量需求超过了通信系统的能力。目前铁路无线通信主要采用了GSM-R,该系统无法为列车用户提供互联网无线接入能力,其窄带特性也难以传输日益丰富的列车监控数据信息,需要向下一代通信网络系统演进发展。伴随着5G系统在公共移动通信中
学位
目的:本研究旨在宏观层面上通过图像分析软件及计算机编程方式,计算出全面的前列腺周围脂肪各类参数,证明其与前列腺癌恶性程度相关;运用基于外轮廓线特征的U-Net卷积神经网络模型,实现对前列腺周围脂肪组织的快速、准确的自动化识别和分割。通过单细胞核测序在微观层面,分析前列腺周围脂肪组织中各类细胞的特征,并分析AR通路抑制剂阿比特龙治疗后各细胞类群谱系的变化,以揭示前列腺周围脂肪组织在肿瘤微环境中的作用
学位
设备到设备(Device-to-Device,D2D)组通信技术在网络终端数量持续增长和通信需求庞大的时代背景下展现出巨大的潜力,具有减轻基站功耗,降低通信延迟,提高信道利用率等优势,但是由于缺乏安全机制而存在数据泄露、身份假冒等诸多安全隐患。本文围绕D2D组通信身份认证和密钥协商方案展开研究,调研发现现有的D2D组通信身份认证和密钥协商协议研究都假设D2D用户与服务器间存在安全信道,但这一点在蜂
学位