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为分析黄土高原水蚀风蚀交错区植被恢复过程中植被与土壤微生物的关系，本研究选择陕西省吴起县退耕还林的主要树种沙棘为研究对象，采用氯仿熏蒸法和高通量测序技术，分别测定土壤微生物碳氮含量和微生物群落多样性，分析沙棘林地土壤微生物特征。选择阴坡沙棘林、阳坡沙棘林、沙棘侧柏混交林、沙棘油松混交林为研究对象，分析各林分不同土壤层土壤微生物特征，并以草地和裸地为对照，同时测定各林分不同土层土壤理化性质特征，研究其对土壤微生物的影响。结果表明:(1)总体而言，除了全磷和全钾外，各林分土壤养分和土壤微生物量碳氮在不同土层有较好的垂直变化规律，其中沙棘油松混交林土壤养分含量总体上低于其他三种林分;(2)土壤微生物量碳氮与土壤总有机碳、全氮及碱解氮的回归模型拟合度高，说明土壤微生物碳氮受土壤碳氮影响显著;(3)沙棘林地细菌种类在门、纲、目、科、属、种的水平上分别有29-34、65-75、123-141、220-254、372-421及734-813种;其中细菌在纲水平上丰富度排列前5的菌种为Actinobacteria（放线菌纲）、Alphaproteobacteria(α-变形菌纲)、Acidobacteria（酸杆菌纲）、Gemmatimonadetes（芽单胞菌纲）、Betaproteobacteria（β-变形菌）、Gammaproteobacteria（γ-变形菌纲）等;各林地真菌种类在门、纲、目、科、属、种的水平上分别有21-24、37-40、57-60、68-73、74-80及99-107种，其中细菌在纲水平丰富度排列前5的菌种为Tremellomycetes(银耳纲)、Intramacronucleata、Pezizomycetes（盘菌纲）、Orbiliomycetes（圆盘菌纲）、Agaricomycetes（伞菌纲）、Dothideomycetes（座囊菌纲）;总体上各林地细菌群落和真菌群落多样性均随土壤深度的增加而减少;(4)单因素方差分析表明细菌和真菌在门水平丰度前10的菌种在不同林分下无显著差异，但细菌中Nitrospirae门和Bacteroidetes门在不同土壤层有显著差异;真菌中Ciliophora门和Chytridiomycota门在不同土壤层有显著差异;即土壤微生物在不同土层的分布差异大于不同林地之间;(5)相关性热图分析表明，土壤细菌和真菌在门水平上大部分菌种与土壤养分显著相关，即土壤养分对菌种的影响作用显著;菌种同时与微生物量碳、氮相关或同时不相关，即土壤微生物量碳、氮能由较为一致的菌种体现出来。