EGFR-TKI耐药基因的筛选及预测非小细胞肺癌预后、免疫浸润的意义

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wfdzdb
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背景:肺癌是全世界范围内公认的高危恶性肿瘤,30-60%的非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)患者存在表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变使得表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)成为了有效的治疗选择。然而患者可能对EGFR-TKI存在原发性或继发性耐药,其中涉及到的分子机制变化并未完全清楚,是急需解决的临床问题。方法:我们利用GEO数据库中对一代和二代EGFR-TKI耐药的非小细胞肺癌基因表达谱,计算得到差异表达基因。对差异表达基因进行表达水平验证、通路富集及生存分析,获取到与非小细胞肺癌预后相关的耐药关键基因。以关键基因不同表达水平及EGFR突变状态对肺腺癌进行分组,计算不同分组的免疫浸润评分,以此来分析关键基因在免疫浸润中作用。最后,我们通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(Quantitative real time polymerase chain reaction,q RT-PCR)验证关键基因在临床EGFR突变非小细胞肺癌和正常癌旁组织中的表达差异,随访相应患者一线用药后的无进展生存期。结果:本研究共发现了107个与TKI耐药相关的差异表达基因。经可视化筛选后获得了11个关联紧密的耐药关键基因,其中关键基因SPP1在高表达时非小细胞肺癌患者预后明显变差。免疫浸润分析结果显示,SPP1高表达的TKI耐药组较SPP1低表达的敏感组,其CD4+T细胞的浸润评分更高,该结果可能为后续免疫治疗提供依据。最后我们通过q RT-PCR验证了SPP1在EGFR突变非小细胞肺癌较正常组织表达显著升高,且SPP1高表达患者的无进展生存期更短。结论:因此我们得出结论,SPP1的高表达可能会诱导非小细胞肺癌对一、二代EGFR-TKI耐药从而导致生存变差,并影响相关的肿瘤免疫浸润。为临床改善EGFR-TKI耐药,提高疗效提供了新的思路。
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