论文部分内容阅读
目的:为了明确氯离子通道蛋白-3(Chloride Channel Protein 3,CLCN3)在脓毒症中与炎症因子之间的关系,利用生物信息学方法、体外细胞实验及脓毒症患者临床试验等方法,研究CLCN3通过NF-κB通路对炎症因子释放的影响,为CLCN3作为脓毒症的潜在治疗靶点提供依据。方法:1、在GEO数据库搜索框中输入“sepsis”进行检索,获取数据集GSE28750,包含10例脓毒症患者及20例健康志愿者全部基因表达信息,分析比较差异基因。通过KEGG富集分析差异基因在脓毒症炎症中的信号通路。最后,另选数据集GSE65517验证脓毒症差异基因。2、收集南昌大学第一附属医院急诊重症监护室2022.9-2023.3期间入院患者中符合脓毒症诊断标准人员20例及健康体检人员10例外周血5ml,分别为实验组(脓毒症患者)与对照组(健康体检人员),提取单核巨噬细胞,用q-PCR检测氯离子通道及炎症因子IL-6、TNF-ɑ的表达,将CLCN3的表达与IL-6、TNF-ɑ的表达进行spearman相关性分析。3、构建体外脓毒症单核细胞模型,分为LPS组、LPS+DIDS组、对照组,LPS组用LPS刺激6、12、24小时,分别在6小时、12小时、24小时提取细胞,用q-PCR技术检测CLCN3、IL-6、TNF-ɑ的表达,用Graphpad Prism9软件制图。LPS+DIDS组使用氯离子通道蛋白阻滞剂DIDS刺激细胞模型6小时,用q-PCR技术检测CLCN3、IL-6、TNF-ɑ的表达,用Werstern Blot技术检测CLCN3、NF-κB的表达,用Graphpad Prism9软件制图。对照组不做处理。为进一步研究CLCN3与炎症之间的关系,用合成的CLCN3特异性小干扰RNA(Si-CLCN3)转染THP-1细胞,分为LPS组、L+S组、对照组,用q-PCR技术检测CLCN3、IL-6、TNF-ɑ的表达水平。结果:1、通过生信分析筛选出3800个差异基因,筛选了个1963个上调基因,1837个下调基因,CLCN3是差异基因中的上调基因,通过KEGG富集分析发现脓毒症发病机制与NF-κB、MAPK等信号路高度相关。2、脓毒症患者临床研究中,q-PCR检测结果提示:脓毒症组中CLCN3及炎症因子IL-6,TNF-ɑ表达水平均高于健康体检患者,有显著差异(P<0.05),且CLCN3的表达与IL-6,TNF-ɑ表达水平呈正相关(R~2=0.58,P=0.0004;R~2=0.35,P=0.0005),提示CLCN3可能参与脓毒症炎症释放。3、体外脓毒症细胞模型中,q-PCR结果提示:随着LPS刺激时间延长,CLCN3、IL-6、TNF-α的表达在6h、12h、24h也升高,组间均有显著差异(P<0.05)。用DIDS阻断CLCN,q-PCR结果提示:CLCN3的表达与IL-6、TNF-ɑ表达同步下降;Werstern Blot结果提示:CLCN3的表达与NF-κB的表达同向改变。用Si-CLCN3沉默CLCN3基因,q-PCR结果提示:CLCN3的表达下降,IL-6、TNF-ɑ的表达也随之下降。提示CLCN3可能通过NF-κB途径促进炎症因子释放。结论:CLCN3通过NF-κB信号通路促进脓毒症炎症因子释放。