随着水污染防治法律制度的不断完善，农村水污染防治受到社会越来越多的关注，新修订的《水污染防治法》首次将农业和农村水污染防治纳入管理范围，因此对农村水污染防治法律制度的研究具有现实意义和必要性。本文通过采用比较分析、系统分析、实证分析、文献梳理的研究方法，对农村水污染防治法律制度的基础理论、国外水污染防治法律制度的启示、我国农村水污染防治法律制度以及如何完善我国农村水污染防治法律制度进行研究，得出结论如下：1.农村水污染防治法律制度基础理论。认为应当以公共物品理论、外部性理论、可持续发展理论、环境权和环境公平理论这五个理论依据为切入点，对农村水污染防治法律制度的概念、特征、目的和意义进行界定，分析农村水污染防治法律制度的指导思想和基本原则，认为农村水污染防治法律制度的体系应包括以下制度：污染物排放总量控制制度、政府环境责任制度、区域环境限批制度、生态保护补偿机制。同时认为公共物品理论、外部性理论、可持续发展理论、环境权和环境公平理论应当作为我国农村水污染防治法律制度分析和完善的基础。2.国外水污染防治法律制度的启示。分析荷兰、瑞典、美国、日本四个国家先进的水污染防治法律制度的现状和特点，主要涉及排污许可证制度，地表水污染税制度、公众参与制度等，认为对我国的启示主要有：提高农村居民环保意识，建立农村水污染防治规划制度、农业生产的环境监管制度，完善农村工业的环境监管制度，鼓励农民群众参与水污染防治等。3.我国农村水污染防治法律制度分析。认为应当认识我国农村水污染现状，从不同层次的相关法律法规分析我国农村水污染防治法律制度现状，从立法、执法、司法三个角度分析其存在的问题，主要包括：立法指导思想错位；立法技术不完善；农村水污染防治制度不全面；农村水污染防治法律法规缺乏系统性和体系化是农村水污染防治执法的主要障碍；从执行方面来看，农村水污染防治以政策意见为主，缺乏长效机制；我国农村水污染防治法律制度对违反农村水污染防治的法律责任规定不明确，导致责任人难以确认；我国农村水污染防治法律制度权利义务的规定不对等，使得相关法律条文缺乏可操作性。同时认为传统观念的制约和农村水污染防治法律制度基础理论研究滞后是这些问题存在的根源。4.我国农村水污染防治法律制度的完善。认为应当从农村水污染防治法律制度的指导思想、基本原则和具体防治制度三方面进行完善：在农村水污染防治法律制度的指导思想中引入“保障水源安全”作为立法目的，农村水污染防治法律制度的基本原则应包括环境公平原则、环境保护与经济社会发展相协调原则、激励约束并重原则和分类治理原则。农村水污染防治制度方面应建立农村水污染防治规划制度，建立农业生产的环境监管制度，建立农村生活污水处理制度，加强我国农村工业的环境监管制度，完善公众参与制度和排污费使用管理制度。通过对我国农村水污染防治法律制度的创新与完善，使得我国农村水污染防治从法律制度层面加以规划，为解决农村水污染问题提供有力法律保障。