短正五聚体蛋白家族CRP和SAP基因在灵长类动物中的遗传分化研究

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短正五聚体蛋白家族(Short pentraxins)由C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)和血清淀粉样蛋白P(Serum amyloid P component,SAP)组成,作为重要的天然免疫模式识别受体,CRP和SAP可参与防御微生物感染或组织损伤,并调节炎症反应。CRP和SAP均为由五个相同亚基组成的同源多聚体,这些免疫识别受体可通过钙依赖方式识别不同微生物的多种外源配体和内源配体并与之结合。此外,CRP和SAP可与补体因子1q(Complement factor 1q,C1q)和Fcγ受体(Fcγreceptor,FcγRs)相互作用,进而激活一系列免疫反应。目前,CRP和SAP已在各个动物类群中已分离出来。在不同物种中,短正五聚体蛋白的亚基以及五聚体虽具有相似的结构特征,但是其功能亦呈现明显的差异。我们对于这些受体分子在不同动物类群中功能差异的遗传学基础的相关研究仍有待深入,这些信息对于深入揭示该类受体功能特征和遗传规律具有重要意义。此外,需要指出的是,虽然灵长类动物已在生物医学研究的诸多领域得到广泛的应用并发挥了重要的作用,但在短正五聚体蛋白功能的相关研究中,已有研究进展主要基于啮齿类动物,而灵长类动物的应用则相对有限,相关认知亦十分匮乏。因此,有必要对灵长类动物的CRP和SAP基因的遗传规律开展深入研究。本研究针对CRP和SAP基因在灵长类动物[包括重要实验动物猕猴(Macaca mulatta)和食蟹猴(M.fascicularis)]中的遗传变异信息展开研究,意图揭示CRP和SAP基因在上述动物类群中的遗传变异规律。本研究收集和测定了33个灵长类物种的CRP和SAP基因完整编码区序列,基于此,我们综合多种遗传学分析方法,包括核酸替代速率比较、最大似然检验和DNA多态性的中性检验等,深入分析了CRP和SAP基因在灵长类动物中的遗传分化特征,主要结论如下:(1)在灵长类动物的演化历程中,CRP和SAP基因均呈现快速适应性变化的遗传特征;(2)CRP和SAP上均有多个氨基酸位点经历了快速的适应性变化,其中CRP发生适应性变化位点78、92、103、166和194位于CRP与配体、效应分子结合或亚基之间结合的相关结构域或邻近区域,与之相似,同样SAP发生适应性变化的位点也位于这些结构域中或邻近区域;(3)猕猴和食蟹猴群体中,CRP和SAP基因则呈现多态性匮乏的特征。上述遗传分化特征为深入阐释CRP和SAP在灵长类这一重要生物类群中的功能特征提供了初步线索,并为今后科学、合理应用上述模式动物及其相关实验材料提供了遗传学基础。
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