大白菜抗根肿病基因CR205的精细定位

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zxsa0519
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大白菜根肿病是一种常见的通过土壤传播的病害,是由一种芸薹属根肿菌(Plasmodiophora brassica)侵染引起的危害十字花科作物的传染性非常强的土壤病害,可导致大白菜产量严重下降,甚至绝收。本试验以沈阳农业大学蔬菜遗传育种实验室培育的大白菜抗根肿病品种‘205’与感病品种‘157’,配制正、反交F1、F2以及回交世代,利用BSA-Seq结合SSR和In Del等分子标记技术,对大白菜根肿菌抗病基因进行定位,研究结果如下:1.利用抗根肿病品种‘205’与感病品种‘157’构建F2群体,并通过调整菌液浓度及植株培养方法,改良了大白菜根肿菌的接菌方法,然后对抗、感病品种及创制的F2分离群体及正、反交组合进行接菌鉴定,调查了遗传规律,确认遗传性状。结果显示F2分离群体的抗感比约为3:1,符合孟德尔遗传遗传规律对质量性状的要求,证明本试验抗病材料受一对显性核基因控制。2.依据BSA-Seq测序要求,选取配制组合时的亲本,及F2分离群体,按照表现型区分的两个性状,各建立两个亲本混池和两个分离群体的极端混池,进行BSA-Seq测序分析,亲本为配制组合时的同一单株10X的测序深度,F2分离群体为30X的测序深度。初步将目标基因定位在A03染色体上。3.依据BSA-Seq的结果,按照每间隔50,000 bp为一个单位设计SSR和In Del标记引物,锁定目标区域后,每间隔20,000 bp设计引物,最终获得了两个遗传距离均为0.25c M的重组单株的标记Bra-CR-123和Bra-CR-125,在两个标记之间有一个基因为Bra A03g055010.3C,是一个富含亮氨酸的重复序列,并且可以编码蛋白质的N端的基因,所以最终将目的基因定位于大白菜数据库3.0版本的Bra A03g055010.3C基因,命名为CR205
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