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目的:通过代谢组学技术建立一种新的评价转基因食品食用安全性的方法，尤其是非预期效应，旨在为转基因食品的安全性评估和监管提供参考。 方法:转基因抗虫水稻长期喂养实验，SD大鼠雌雄各半，随机分成转基因组、非转基因组和基础饲料组三组，进行20个月连续喂养，收集了18个月和20个月这两个时间点的血液。转基因抗虫水稻饲喂SD大鼠的三代两窝繁殖实验，SD大鼠雌雄各半，随机分成转基因组、非转基因组和基础饲料组三组。二代第二窝子鼠饲养120天左右生产出三代第一窝子鼠，三代第一窝子鼠饲养160天左右生产出三代第二窝子鼠。三代第二窝子鼠离乳后饲养75天左右中期采血，饲养108天左右末期采血。转基因抗旱小麦喂养实验，SD大鼠雌雄各半，随机分成转基因组、非转基因组和基础饲料组三组，进行12个月连续喂养，收集了3个月和12个月这两个时间点的尿液。利用超高效液相色谱-四级杆飞行时间质谱联用仪对饲喂转基因食品的SD大鼠的血清/尿液进行代谢组学分析，结合多元统计分析方法进行数据处理。首先采用非监督的PCA方法观察各组样品之间的总体分布情况，然后利用有监督的PLS-DA方法区别各组间代谢轮廓的差异。 结果:在转基因抗虫水稻长期饲喂SD大鼠的血清代谢组学研究中，发现不同性别之间、不同饲料组之间形成明显的分类趋势，存在代谢差异，但是同一性别下，转基因喂养组与非转基因喂养组没有分类趋势，不存在代谢差异。在转基因抗虫水稻饲喂SD大鼠繁殖产生的第三代子鼠的血清代谢组学研究中和在转基因抗旱小麦饲喂SD大鼠12个月的尿液代谢组学研究中，我们也得到了类似的结果，不同性别之间、不同饲料组之间存在代谢差异，但是转基因喂养组和非转基因喂养组之间不存在代谢差异。 结论:首次采用UPLC-Q-TOF/MS对饲喂转基因食品的SD大鼠的血清和尿液进行了系统的代谢组学分析，发现三组动物实验中转基因组和非转基因组在代谢水平上都不存在差异，饲喂转基因食品对SD大鼠机体代谢没有产生影响。虽然在本研究中我们发现摄入转基因食品没有导致实验动物在代谢水平发生非预期效应，但是还需要进一步验证。