中国人群2型糖尿病遗传易感性的分子流行病学研究

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2型糖尿病是全球重要的公共卫生问题之一,近二十年来,随着我国经济的发展,人们的生活方式发生了显著的改变,2型糖尿病的患病人数呈急剧增加趋势,目前我国约有9000多万糖尿病患者和1.5亿糖尿病前期患者。2型糖尿病已成为威胁我国居民生命和健康的重要疾病之一,是亟待解决的重大公共卫生问题。2型糖尿病的发生是遗传因素和环境因素共同作用的结果,研究认为,2型糖尿病患病率日益上升是日益增加的环境因素如高热量饮食、缺乏体力活动等作用于糖尿病易感者的结果。鉴于2型糖尿病发生的具体病因和发展机制尚不明确,以往基于候选基因研究策略研究发现2型糖尿病易感基因的进展比较缓慢。近年来,随着GWAS(Genome-wideAssociation Study,全基因组关联研究)技术的推出,明显加速了探索速度,目前已约有40余个与2型糖尿病相关的位点被鉴定出来。由于目前大多数的GWAS是在欧洲裔人群中进行的,而不同种族人群的遗传背景和环境因素存在种族差异,以及GWAS发现的位点并非真正具有功能意义的变异位点,所以很有必要在中国人群中对这些位点与2型糖尿病的发病风险的关系进行验证研究。因此,本研究的科研假设是:GWAS报道的来自不同种族人群的2型糖尿病相关基因(区域)也是我国人群2型糖尿病的遗传易感基因(区域),这些区域的SNPs(Single Nucleotide Polymorphisms,单核苷酸多态性)与本地区汉族人群2型糖尿病发病风险存在关联。为了验证上述假设,本研究基于国际上GWAS最新研究进展,采用两阶段病例-对照研究设计,通过精细作图(fine mapping)的研究策略,探讨了染色体10q23.33区域遗传变异与中国江苏汉族人群2型糖尿病遗传易感性的关系;通过候选位点(candidate loci)的研究策略,对目前国际上2型糖尿病GWAS报道的35个基因(区域)的48SNPs与中国江苏汉族人群2型糖尿病发病风险的关系进行了验证研究,并分析了基因-基因、基因-环境对2型糖尿病发生的联合作用。本研究结果对于进一步评价和识别中国汉族人群2型糖尿病的遗传易感因素,阐明2型糖尿病的发病机制具有重要的理论和现实意义。第一部分染色体10q23.33区域遗传变异与中国江苏汉族人群2型糖尿病易感性的“精细作图”研究在欧洲裔、亚洲裔人群的GWAS研究都将2型糖尿病的易感区域定位于染色体10q23.33区域,该区域包含三个基因,分别是IDE(Insulin-degrading Enzyme,胰岛素降解酶)基因、 KIF11(Kinesin-interacting Factor11,驱动蛋白交互因子11)基因和HHEX(Hematopoietically Expressed Homeobox,同源框转录因子)基因。IDE基因编码一种细胞间金属肽酶,其降解产物包括胰岛素和多种淀粉样蛋白等;KIF11目前功能未知;HHEX基因编码含同源框的转录因子,高表达于胚胎及成熟的胰腺中,HHEX基因敲除的小鼠会出现胰腺发育缺陷。rs1111875、rs5015480和rs7923837是该区域发现的3个欧洲裔人群2型糖尿病的易感位点,但是此区域的功能相关的致病位点尚未知,且中国人群与欧美人群存在遗传背景的差异。因此,我们的研究假设是染色体10q23.33区域是中国人群2型糖尿病的易感区域,但是需系统评价此区域的遗传变异与2型糖尿病的关系。为了验证上述假设,我们采用精细作图的策略,根据中国人群在10q23.33区域LD(Linkage Disequilibrium,连锁不平衡)图谱选择19个tSNPs (taggingSNPs,标签SNPs),应用两人群(江苏苏南无锡和苏中南通)、两阶段大样本病例-对照研究(two-stage case-control study)设计:第一阶段采用1200例2型糖尿病病例和1200例对照进行初筛,随后第二阶段采用1725例2型糖尿病病例和2081例对照进行独立验证,探讨10q23.33区域常见SNPs与中国人群2型糖尿病遗传易感性的关系;依据关联研究结果结合LD分析筛选潜在功能性位点,检验其与中国人群2型糖尿病发病风险的关系。关联研究显示,GWAS报道的易感位点rs1111875、rs5015480和rs7923837危险等位基因频率在中国汉族人群中低于欧美人群,在两阶段研究中均与中国人群2型糖尿病发病风险显著关联(P<0.05)。两阶段合并后,Logistic回归分析显示,经年龄、性别、BMI (Body Mass Index,体质指数)校正后,三位点rs1111875、rs5015480和rs7923837与2型糖尿病发病风险关联的OR(95%CI)分别为1.23(1.13-1.35)、1.25(1.12-1.39)、1.33(1.21-1.47),关联效应最强的位点是rs7923837(P=6.8E-9);独立效应研究显示rs1111875多态性是此区域增加2型糖尿病发病风险的另一独立位点;rs7923837和rs1111875两位点多态性对2型糖尿病发生具有累积效应,携带1个、2个、3或4个危险等位基因的个体发生2型糖尿病的风险分别是未携带危险等位基因的1.27、1.44和1.73倍。我们的研究结果表明染色体10q23.33区域是中国汉族人群的2型糖尿病易感区域,该区域的2个SNPs rs7923837和rs1111875代表两个独立的位点与中国汉族人群2型糖尿病发病风险相关。本研究采用的精细作图策略有助于发现有效的疾病易感位点,缩小潜在致病位点的研究范围,是识别疾病致病位点有效途径。第二部分基于GWAS的中国人群2型糖尿病遗传易感位点的鉴定和风险预测模型研究从2007年,Sladek et al首次在法国人群中报道2型糖尿病GWAS研究结果到现在(2010年10月),国际上相继发表了20余篇关于2型糖尿病为表型的GWAS的研究报道,涉及欧洲裔、亚洲裔等不同种族人群,累计共发现了40余个基因(区域)的单核苷酸多态性与2型糖尿病相关,这些基因(区域)包括:HHEX、SLC30A8、LOC387761、EXT2、CDKN2A/2B、IGF2BP2、CDKAL1、KCNJ11、PPARG、FTO、JAZF1、CDC123-CAMK1D、TSPAN8-LGR5、THADA、ADAMTS9、NOTCH2、KCNQ1、PEPD、PTPRD、SRR、SPRY2、C2CD4A-C2CD4B、RBMS1/ITGB6、IRS1、MTNR1B、BCL11A、ZBED3、KLF14、TP53INP1、CHCHD9、CENTD2、HMGA2、HNF1A、ZFAND6、PRC1、DUSP9、UBE2E2、ADCY5、PROX1、GCK、GCKR、DGKB/TMEM195等。因此,在本研究中我们假设这些基因(区域)的一些重要遗传变异与本地区汉族人群2型糖尿病的发病风险存在关联并可应用于人群2型糖尿病发病风险预测。为验证上述研究假设,我们采用以社区人群为基础的两阶段病例-对照研究来筛选、验证与中国江苏汉族人群2型糖尿病发病风险相关的易感位点。第一阶段在来自江苏无锡的1200例2型糖尿病病例和1200例正常对照中,对GWAS报道SNPs按照一定的选点标准,对筛选出的35个基因(区域)的48个SNPs进行基因型检测,筛选与该地区人群2型糖尿病发生发展显著关联的SNPs;第二阶段在来自于江苏南通的1725例2型糖尿病病例和2081例匹配的健康对照中,对第一阶段筛选出的显著的SNPs进行验证。研究结果显示,8个基因(区域)的15个SNPs与本地区汉族人群2型糖尿病的易感性显著相关(P<0.05),分别是CDKAL1基因的rs7756992(OR=1.29,95%CI:1.19-1.40)、 rs6931514(OR=1.29,95%CI:1.19-1.39)、 rs4712524(OR=1.24,95%CI:1.15-1.35)、 rs4712523(OR=1.25,95%CI:1.15-1.35),VEGFA基因的rs9472138(OR=1.19,95%CI:1.05-1.34), SLC30A8基因的rs13266634(OR=1.19,95%CI:1.10-1.29),CDKN2A/2B基因的rs10811661(OR=1.30,95%CI:1.20-1.41),HHEX基因的rs1111875(OR=1.23,95%CI:1.13-1.35)、rs7923837(OR=1.33,95%CI:1.21-1.47)、rs5015480(OR=1.25,95%CI:1.12-1.39), KCNQ1基因的rs2237897(OR=1.41,95%CI:1.30-1.54)、rs2237892(OR=1.35,95%CI:1.24-1.47)、 rs2237895(OR=1.22,95%CI:1.12-1.33), CENTD2基因的rs1552224(OR=1.28,95%CI:1.10-1.48), FTO基因的rs8050136(OR=1.17,95%CI:1.03-1.32)。其中,KCNQ1基因的rs2237897的多态性与2型糖尿病的发病风险关联最强。经独立性效应分析,共有位于8个基因区域的9个SNPs(CDKAL1基因区域的rs7756992、VEGFA基因区域的rs9472138、 SLC30A8基因区域的rs13266634、 CDKN2A/2B基因区域的rs10811661、HHEX基因区域的rs1111875和rs7923837、KCNQ1基因区域的rs2237897、CENTD2基因区域的rs1552224、FTO基因区域的rs8050136)作为独立变量用于分析基因-基因、基因-环境的联合效应和构建2型糖尿病发病风险模型。基因-基因、基因-环境联合效应分析显示,携带12个及以上危险等位基因数的个体发生2型糖尿病的风险是携带0-5个危险等位基因数的个体的3.68倍;若加上环境因素(超重/肥胖),携带13个及以上危险因素的个体发生2型糖尿病的风险是携带0-7个危险因素的个体的8.32倍。分别以三种不同的变量组合预测2型糖尿病的发病风险,在只调整年龄或调整年龄和2型糖尿病家族史的模型中,加入遗传危险分值(Genetic Risk Score)会显著提高对2型糖尿病发病风险的预测能力(P<0.0001),而在调整年龄、2型糖尿病家族史和临床危险因素模型中,因AUC(Area Under the Receiver Operator Characteristic Curve,受试者工作特征曲线下面积)已达较高数值,加入遗传危险分值对AUC改善不大。因此,我们的研究结果表明,CENTD2, VEGFA, CDKAL1, SLC30A8,CDKN2A/2B, HHEX, KCNQ1, FTO基因(区域)遗传变异与中国江苏汉族人群2型糖尿病的遗传易感性相关,基因-基因、基因-环境对2型糖尿病的发生具有联合作用,加入遗传信息可提高对2型糖尿病发病风险预测能力。
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