观光木SSR遗传多样性分析

来源 :中南林业科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Monking
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
观光木(Tsoongiodendron odorum Chun),隶属于木兰科(Magnoliaceae)观光木属(Tsoongiodendron),单属种植物,是著名的观赏植物,也是我国南方著名的珍稀濒危树种,已被列为国家二级珍稀濒危重点保护植物。观光木是古老的孑遗树种,对研究古代植物区系、古气候和古地理等具有重要的科学价值。本研究基于SSR标记研究了国内6个省区的22个观光木天然种群的遗传多样性与遗传结构,以期从种群遗传学角度探讨其濒危机制。主要研究结果如下:(1)观光木SSR-PCR反应体系优化在单因素试验基础上采用正交试验来优化影响观光木SSR-PCR扩增的主要因素,获得一套适合观光木的最佳SSR-PCR扩增体系(10μl):Mg2+1.0mmol/L,dNTP 0.20mmol/L,引物0.25 μmol/L,Taq DNA聚合酶0.75U,模板DNA 60ng。PCR扩增程序:94℃预变性5 min;94℃变性45s,退火50s,72℃延伸90s,共35个循环;最后72℃延伸5min,4℃保存。(2)观光木遗传多样性利用SSR-PCR扩增优化体系和筛选出的6对SSR特异引物对观光木22个天然种群372株样本进行遗传多样性分析。在物种水平上,共检测到19个等位基因,每个位点的观察等位基因数平均为3.1667;有效等位基因数平均为2.5445;Shannon信息指数平均为0.9864;观察杂合度平均为0.4084;期望杂合度平均为0.5916;Nei’s期望杂合度平均为0.5908。在种群水平上,各种群的观察等位基因数平均为2.7424;有效等位基因数平均为2.1643;Shannon信息指数平均为0.8153;观察杂合度平均为0.1859;期望杂合度平均为0.5267;Nei’s期望杂合度平均为0.4960。结果表明观光木在物种和种群水平上均具有较高的遗传多样性。各种群遗传参数综合比较下,黎平(LP)种群的遗传多样性水平最高,定南(DN)种群的遗传多样性水平最低,推测这与采集样本数量多少以及其生存环境有关。(3)观光木种群遗传分化分子方差分析结果表明,86.77%的遗传变异发生在种群内,13.23%(P<0.001)的遗传变异存在于种群间,遗传分化系数GST为0.13227,说明观光木种群存在一定的遗传分化。POPGENE软件分析结果显示各标记位点的遗传分化系数FST为0.1166~0.2173,平均为0.1769;种群间基因流Nm在0.9007~1.8941之间,平均为1.1633,说明观光木种群之间存在一定的基因交流。(4)观光木遗传结构观光木22个种群之间的Nei’s无偏遗传距离(GD)介于0.0189~0.7378之间,梁野山(LYS)与万木林(WML)种群之间的遗传距离最小为0.0189,龙潭角(LTJ)和龙南(LN)种群之间的遗传距离最大为0.7378。基于22个观光木种群间的Nei’s无偏遗传距离对其进行UPGMA聚类,分析结果表明22个观光木种群被聚为4类:龙南(LN)种群独立聚为一类;崇义(CY)、车八岭(CBL)和鼎湖山(DHS)种群聚为一类;荔波(LB)、井冈山(JGS)、大余(DY)、金秀(JX)、定南(DN)以及乳源(RY)种群聚为一类;其余种群聚为一类。基于贝叶斯分析的STRUCTURE软件检测结果显示参试的372株观光木个体的最佳组群数为4,与UPGMA聚类结果有部分差异,有些个体存在一定的谱系混杂现象,说明部分种群间有一定的基因流动。(5)观光木濒危机制与保护策略综上所述,尽管观光木处于濒危阶段,但其遗传多样性维持在较高水平,进化潜力较大,说明遗传多样性水平不是其濒危的主要原因。我们认为观光木濒危的可能原因包括其种子不易萌发、大孢子发生发育异常、生境遭破坏或片段化以及人为干扰严重等。建议对观光木采取因地制宜的保护策略,对遗传多样性水平较高的黎平(LP)、江永(JY)、梁野山(LYS)3个天然种群优先加以就地保护;对数量少、零散分布以及生境遭破坏严重或者片段化的观光木种群进行迁地保护,并进行栽培繁殖等相关研究,促进其天然更新。此外,应注重提高人们保护濒危植物的意识,合理开发利用观光木遗传资源,避免过度采伐。
其他文献
生产调度问题作为一类有着极强应用背景的组合优化问题,存在于实际生活中的许多领域,如金属加工、钢铁冶炼、物流行业等。对生产调度问题进行研究的主要目的是因为它在提高劳
本研究聚焦于探索环城游憩带的形成需要什么条件、会经历哪些阶段、不同阶段的划分依据是什么等问题。在全面梳理已有的关于环城游憩带的理论及概念的基础上,进一步明确了环
近年来,随着我国国民经济发展水平的不断提升,尤其是伴随电力体制改革,城镇化步伐以及新能源发展速度加快,电力负荷呈现出一种增长速度较快、变化幅度较大且形式多样化的新趋势,电力需求持续上升。为满足人民生产生活必需的用电需求,电网企业需要不断扩大其投资建设规模,从而提升其供电能力。但从近几年的投资规模可以看出,电网投资规模虽不断扩大但其增速正逐步放缓,这表明我国电网发展正从高速度增长转向高质量发展,意味
壳聚糖(CS)作为天然的多糖大分子,因来源广、价格低、可降解以及具有良好的生物相容性等特点,在医用材料、化妆品开发等方面具有重要的应用价值。壳聚糖中含有丰富的-OH,-NH2
在科技创新浪潮高涨的背景下,全球信息化和产业化网络逐渐形成,使得世界各国的距离变小,时空已经无法成为制约世界经济发展和科技创新活动开展的阻碍,资金、劳动力等生产要素
行为金融在世界范围内都很流行,投资者情绪在股票市场中的作用越来越受到国内外学者的关注。投资者情绪的变化导致投资者的非理性投资行为,这可能导致股票价格异常变化,从而损害股票市场的稳定性并导致金融危机。我国股票市场以个人投资为主要驱动,个人投资者的交易行为易受情绪左右,因此投资者情绪将对中国股票收益的产生重大影响。本文研究了投资者情绪对不同股票市场收益率相关性的影响,具体如下:第一,综合考虑客观和主观
近年来,《行政诉讼法》的修订和最高人民检察院、最高人民法院出台相关的司法解释,环境行政公益诉讼在我国全面实施,环境行政公益诉讼的诉前程序作为法律规定的相关内容,开始成为学术界研究的热门话题之一。在立法层面环境行政公益诉讼程序相关制度得到了确定和完善,诉前程序的定义、内容逐渐明确。建立检察机关提起环境公益诉讼制度是党的十九大关于建设中国特色社会主义法治体系、建设社会主义法治国家的重要制度安排。作为检
浙江省早在1987年就提前进入了老龄化社会。嘉兴作为浙江省一个地级市,连续10年老龄化程度位居全省榜首。经济社会的未富先老、家庭养老的日渐式微、机构养老的资源稀缺,使得
随着国家对现代化建设的大力投入,地下工程、基建、交通等各个领域的工程建设蓬勃开展。在这些工程建设中,岩体爆破技术都有着广泛的应用。但由于岩体本身具有非均质性和各向
随着我国经济建设的快速发展和城市化的推广,城市交通拥堵问题日益严重。在许多大中型城市中,交通拥堵问题已经成为制约城市发展的一个主要因素,而在拥堵的车辆中,小型车辆则占了所有行驶车辆的主体。所以如果能够将小型车辆进行有效的分流就可以大大减缓城市的拥堵现象,为此目的,我们提出了城市轻架桥的概念。城市轻架桥仅限于小型车辆通行、不占用现有城市道路资源、快速环保,不失为解决城市道路拥堵的一种有效方法,主要的