医药商业流通体制改革是一个老生常谈的话题。长期以来，较医药工业企业来说，我国的医药商业企业受到的行政性保护期限比较长，体制僵化，秩序混乱，多头管理，实际上却处于“无人管理”状态。1998年，国家药品监督管理局成立后，才结束了这种“管理者缺位”状态，我国的医药流通秩序逐渐好转，但是，由于我国正处于社会主义市场经济体制改革过程中，各项改革政策的出台并不同步，各方面的关系没有从根本上理顺，医药商业企业仍然处于不景气状况，已经成为医药经济快速发展的“瓶颈”。现在，我国已经正式加入世界贸易组织，医药商业领域对外资开放已经为期不远，可以说，我国的医药商业企业所存在的环境发生了激烈的、非线性的变化。面临新的环境，医药商业企业应该如何运作，本文主要从医药商业体制市场化改革的角度作了探讨。 我国正在进行的市场经济体制改革，其影响是广泛而又深远的，远远超出了经济的范畴，这个大环境决定了医药商业体制改革的方向。在简要回顾我国医药商业体制改革的历史进程后，本文从建立社会主义市场经济的要求出发，在考察了当前我国医药商业的优势与劣势，环境的机遇与挑战后，并在已有研究成果的基础上，提出：现阶段，我们应该以“入世”为契机，抓紧政府职能转换，加强对医药流通秩序监管，制定产业政策引导医药商业产业升级，放开对医药商业企业经营的行政性干预；积极探索，通过股份制改造等形式，实现国有资产在医药商业领域的退出机制。