我国并购活动起步较晚，但伴随着加入WTO和市场化程度的提高，世界经济波动对我国经济的影响越来越大，一方面我国经济迅猛发展，资本市场方兴未艾，另一方面并购活动层出不穷，并购市场异常活跃。医药行业的并购也概莫例外。同时，在现有计划生育政策的影响下，我国正在快速迈入老龄化社会，医疗保健对社会的影响将越来越大，医药行业作为这样一个永远的朝阳行业对我国未来整体经济的发展将起到至关重要的作用，这也是为什么近年来我国不断出台推进医药行业改革政策的原因。要实现医药行业的良性发展，并购的有效性不可忽视，因此对医药行业上市公司并购绩效的研究就有了其现实意义。论文按照从理论基础—行业状况—建立评价体系—实证分析的体系来研究医药行业上市公司的并购绩效。以会计研究法为基础，选取2007-2008年发生并购的医药行业的40个上市公司为样本，运用基础性描述统计和因子分析法进行实证分析—对比并购前一年、并购当期、并购后一年，并购后两年的企业绩效的综合得分，得出以下研究结论：销售净利率、可持续增长率、资本保全率在并购当年都有恶化，都呈现出先降后升再下降的趋势。但是即使再下降也不会回到并购前的水平。因此可以认定并购事件是会带来一定的绩效提高的。另外，从因子分析的角度来看，我国医药行业上市公司并购发生当期相对于并购前一年，其绩效是有所下降的。但在并购发生后的第一年和并购发生后的第二年，医药行业上市公司的并购绩效是有一个平稳上升的趋势。再次可以看出并购会带来一定的绩效提高。最后，针对医药行业上市公司在并购中出现的问题，结合当今的国家经济政策和经济形势，在实证分析的基础上，以提高并购绩效为目的，提出对策建议。