随着我国经济的快速发展和城市化进程的加快,建设用地需求迅猛增加,土地市场急剧升温,土地关系十分紧张。政府土地管理部门负有审批土地、监督土地使用、查处土地违法案件的职责,而土地违法案件仍频频发生,因土地利用而出现的利益冲突呈现多层次性、多面性,原因在于现实的土地行政过程无法有效调整利益主体间复杂的利益关系。整合利益格局、优化土地行政系统成为土地行政发展的必然使命。基于土地行政中涉及的利益关系复杂、广泛,本文运用博弈论和利益分析法对土地行政过程中的利益主体关系进行了研究,从而为政府更好的协调各方利益主体、促进和谐土地行政发展提供决策参考。本文首先梳理了土地行政、土地行政过程、利益、利益主体、博弈论等概念和理论,接着按照决策、执行和监督三个阶段对土地行政过程进行了利益博弈分析。本文以耕地保护政策的决策为例分析了中央政府与地方政府以及地方政府之间的利益关系；以土地征收为例分析了中央政府、地方政府、用地企业、农村集体经济组织和农民之间的利益关系；在土地监督过程中,从土地监察、土地督察、社会监督三个方面对各利益主体进行了博弈分析。在土地行政决策过程中,政府的决策依据是公共利益,但是现实中不同利益主体之间在利益分配上往往是相互冲突的,应当优化现有的土地行政决策过程,即建构利益表达、利益综合、政策确定、政策实施、信息反馈及政策的再制定循环而成的土地政策决策过程,必须改善决策制度法律环境。在土地行政执行过程中,中央政府考虑的是大局利益,即注重整体发展、效率与公平；而地方政府主要追求的是局部利益；微观经济主体(企业、个人)则是优先追求的是自己和所属组织的利益；应当在追求公共利益的最大实现的前提下,统筹协调以上主体在土地行政过程中的利益目标实现。在土地行政监督过程中,我国已形成了网络化的监督格局,但是多股监督力量和主体因利益目标的不同而相互冲突、相互牵制,阻碍了土地行政监督目标的实现和监督的有效性。应当整合土地行政系统中的监督权,提高监督权的位阶,加强土地督察部门与环保、产业、社会保障部门的协同关系,促使地方政府转变发展模式,完善人大代表、政协委员的常任制,赋予土地监察员以相应的监督权力。本文最后从系统论、公共行政精神、行政三分制、利益整合、熵增原理等五个方面对土地行政系统优化模型进行了探索。