低分子量-PAHs对A549细胞PI3K/AKT信号通路和EMT影响的分子机制研究

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:colossus198201
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:多环芳烃(Polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)作为细颗粒物(Fine particulate matter,PM2.5)的主要有机组成成分,可引起多种呼吸系统疾病。本课题组前期体内外研究发现,低分子量-PAHs(Low molecular weight-PAHs,LMW-PAHs)可引起大鼠肺组织和人肺腺癌基底上皮细胞(A549)发生氧化应激和炎症反应,该过程可能与PI3K/AKT等信号通路的激活有关,且联合作用高于单独作用。因此,本研究在前期研究基础上,通过构建菲(Phe)和芴(Flu)两种LMW-PAHs联合暴露致炎症反应过程中内源性竞争性RNA(Competitive endogenous RNA,ceRNA)网络,找寻确定的circRNA-miRNA-mRNA调控环路,探索LMW-PAHs诱导炎症反应的转录调控规律,以期深入研究LMW-PAHs暴露致炎症的分子机制。方法:(1)以600μM的Phe和Flu混合物染毒A549细胞24小时,提取总RNA,全转录组测序检测差异表达的circRNAs、miRNAs和mRNAs,并进行GSEA富集分析;基于基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库富集分析结果筛选出与炎症相关的基因;(2)使用Target Scan(v5.0)、miRanda(v3.3a)软件对显著性差异的nc RNAs分别进行靶基因预测(miRNA的靶基因为mRNA,circRNA的靶基因为miRNA);取预测的交集,基于共同的miRNA结合构建ceRNA网络,结合Cytoscape软件构建网络图,实现调控关系的可视化;(3)使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证部分RNAs的表达水平,结合文献选取目标circRNA-miRNA-mRNA调控轴,并检测参与基因(hsa_circ_0039929/hsa_miR-15b-3p_R-1/FGF2)在200、400和600μM的LMWPAHs(Phe+Flu)染毒水平的表达剂量效应关系;(4)使用Western blot检测不同浓度LMW-PAHs处理对PI3K/AKT信号通路和EMT标志物相关蛋白的表达水平;(5)使用mimics过表达hsa_miR-15b-3p_R-1,分别进行单独过表达实验(分为Mock组、NC.组、Mimics组)和过表达后LMW-PAHs染毒实验(分为Mock+Control组、NC.+Control组、Mimics+Control组、Mock+LMW-PAHs组、NC.+LMW-PAHs组、Mimics+LMW-PAHs组),RT-qPCR检测ceRNA相关基因水平,Western blot检测FGF2、PI3K/AKT信号通路和EMT相关蛋白水平;(6)使用siRNA-1和siRNA-2两个干扰位点敲低hsa_circ_0039929,分别进行单独低表达实验(分为Mock组、NC.组、siRNA-1组、siRNA-2组)和低表达后LMW-PAHs染毒实验(分为NC.+Control组、siRNA-1+Control组、siRNA-2+Control组、NC.+LMW-PAHs组、siRNA-1+LMW-PAHs组、siRNA-2+LMWPAHs组),RT-qPCR检测ceRNA相关基因水平,Western blot检测FGF2、PI3K/AKT信号通路和EMT相关蛋白水平。结果:(1)测序和生物信息学分析:转录组测序结果显示,经LMW-PAHs(600μM Phe+Flu)处理的A549细胞中,有195个circRNA、106个miRNA和1838个mRNA在实验组和对照组中显著差异表达(P<0.05)。差异基因GSEA富集分析显示,炎症反应、PI3K/AKT信号通路和EMT是主要富集的生物学过程;(2)基因筛选和验证:根据基因功能富集分析和ceRNA机制筛选出14个mRNA、62个miRNA和181个circRNA构建与炎症相关的circRNA-miRNAmRNA网络。RT-qPCR验证网络中14个mRNA、13个miRNA和10个circRNA基因表达水平,分别有8个mRNA、7个miRNA和5个circRNA表达趋势与测序结果一致,组成11条ceRNA。基于基因功能和文献,选取hsa_circ_0039929/hsamiR-15b-3p_R-1/FGF2作为本研究目标ceRNA。经验证,与对照组相比,200μM和600μM LMW-PAHs组hsa_circ_0039929的表达水平显著升高;而hsa-miR-15b-3p_R-1的表达水平随着LMW-PAHs浓度的升高呈剂量依赖性下降趋势(P<0.05)。FGF2基因和蛋白表达水平在400μM和600μM组中,与对照组相比均显著上调(P<0.05)。(3)LMW-PAHs对PI3K/AKT通路和EMT的影响:经200、400和600μM的LMW-PAHs染毒处理24小时后,与对照组相比,PI3K、AKT总蛋白表达水平各浓度组间均无显著变化(P>0.05),而磷酸化水平在400和600μM组均显著上调(P<0.05)。与200μM组相比,AKT总蛋白水平在600μM组有显著升高,p-PI3K水平在400和600μM组都显著升高(P<0.05)。另外,与对照组相比,各LMW-PAHs处理组上皮标志物E-cadherin的表达水平显著下降,间充质标志物Vimentin和α-SMA蛋白表达水平显著上升(P<0.05)。(4)hsa-miR-15b-3p_R-1过表达对相关基因及PI3K/AKT通路和EMT的影响:1)单独过表达:与空白对照组(Mock)相比,过表达hsa-miR-15b-3p_R-1可显著下调hsa_circ_0039929和FGF2表达水平(P<0.05);引起p-PI3K、pAKT和细胞间充质标志物Vimentin和α-SMA的蛋白表达水平升高,上皮标志物E-cadherin的蛋白表达水平降低(P<0.05);2)过表达后LMW-PAHs染毒:(1)与空白对照组(Mock+Control)相比,Mimics+Control组hsa-miR-15b-3p_R-1基因表达水平显著上调,hsa_circ_0039929基因表达水平显著下调,FGF2的基因和蛋白水平均显著下调(P<0.05)。与暴露对照组(Mock+LMW-PAHs)相比,Mimics+LMW-PAHs组hsa-miR-15b-3p_R-1基因表达水平显著升高(P<0.01),hsa_circ_0039929呈下调趋势,但差异无统计学意义(P>0.05),FGF2的基因和蛋白表达水平均显著下降(P<0.05);(2)PI3K/AKT信号通路和EMT标志蛋白,与Mock+Control组相比,Mimics+Control组PI3K和AKT的总蛋白水平在各组间均没有显著变化(P>0.05),其磷酸化水平以及细胞间质标志物Vimentin和α-SMA的表达水平显著下降,上皮标志物E-cadherin表达水平显著上升(P<0.05);与Mock+LMW-PAHs组相比,Mimics+LMW-PAHs组中,p-PI3K和p-AKT的水平、Vimentin和α-SMA表达水平仍然显著下调(P<0.05),而E-cadherin的表达水平没有明显变化(P>0.05)。(5)hsa_circ_0039929低表达对相关基因及PI3K/AKT通路和EMT的影响:1)单独低表达:与Mock组相比,低表达hsa_circ_0039929可以显著上调hsa-miR-15b-3p_R-1基因表达水平,显著下调FGF2的基因和蛋白水平(P<0.05)。Western blot分析显示,与Mock组相比,siRNA-1和siRNA-2组中PI3K和AKT总蛋白水平没有显著变化,磷酸化水平显著降低(P<0.05);EMT标志物中Vimentin和α-SMA表达水平显著升高,E-cadherin表达水平显著降低(P<0.05);2)低表达后LMW-PAHs染毒:根据前述结果,Mock和NC.组基因和蛋白表达水平均无显著差异,故以NC.+Control和NC.+LMW-PAHs作为对照组。(1)与NC.+Control组相比,siRNA-1+LMW-PAHs组和siRNA-2+LMW-PAHs组中hsa_circ_0039929基因显著下调,hsa-miR-15b-3p_R-1基因显著上调,FGF2的基因和蛋白水平均显著下调(P<0.05);与NC.+LMW-PAHs组相比,hsa_circ_0039929基因在siRNA-2+LMW-PAHs组显著下调,hsa-miR-15b-3p_R-1基因在siRNA-1+LMW-PAHs组和siRNA-2+LMW-PAHs组均显著上调,FGF2蛋白表达水平在siRNA-1+LMW-PAHs组和siRNA-2+LMW-PAHs均显著下调而基因水平仅在siRNA-1+LMW-PAHs组显著下调(P<0.05);(2)PI3K/AKT信号通路和EMT标志蛋白,与NC.+Control组相比,各处理组中PI3K、AKT的总蛋白水平均没有明显变化,siRNA-2+Control组中p-PI3K、p-AKT的水平和显著下降,siRNA-1+Control组中Vimentin和α-SMA蛋白表达水平显著下降(P<0.05);与NC.+LMW-PAHs组相比,siRNA-1+LMW-PAHs组的p-PI3K、p-AKT的水平显著下降(P<0.05),siRNA-1+LMW-PAHs和siRNA-2+LMW-PAHs组中Ecadherin显著上升、Vimentin显著下降,α-SMA蛋白仅在siRNA-2+LMW-PAHs组显著下降(P<0.05)。结论:LMW-PAHs(Phe+Flu)可激活A549细胞中PI3K/AKT信号通路,诱发EMT,其分子机制可能为hsa_circ_0039929作为hsa-miR-15b-3p_R-1的“海绵”并抑制其有效性,从而上调FGF2的表达,激活PI3K/AKT信号通路,诱导EMT发生。
其他文献
目的:通过对2011-2020年甘肃省5岁以下儿童发热伴出疹症候群监测数据的分析研究,观察其病原分布特征,揭示病原感染流行规律,明确主要病原种类;并根据其分布规律构建主要病原阳性率预测模型,估计甘肃省5岁以下儿童发热伴出疹症候群主要病原流行趋势,为相应的疾病防控提供可应用的方法和技术参考。方法:采用观察性研究方法分析2011-2020年甘肃省5岁以下儿童发热伴出疹症候群病例分布及病原构成情况,用χ
学位
在社会经济快速发展背景下,人们对机动车的需求量持续增加,导致私家车总量超过了道路交通系统的容纳量,进而出现了交通拥堵等问题。自动驾驶车辆的出现为缓解道路交通拥堵问题提供了新思路。随着自动驾驶技术的日益完善,现有道路交通系统中已存在不同程度的自动化车辆与手动驾驶车辆混行,且未来道路交通系统将以这种混行的方式为主。混行的交通流特性不同于传统手动驾驶车辆的交通流特征,因此,研究自动驾驶车辆与手动驾驶车辆
学位
氮是自然生态系统中含量最丰富的元素,氮元素在自然界中的存在形式主要为有机氮、无机氮和气态氮等。然而,含氮物质也是导致水体环境恶化的主要污染物之一。课题组在前期研究中发现生物海绵铁体系对氮素也有较强的去除效果,并且此体系中可以产生较强的类Fenton作用。因此本实验便在前期研究的基础上,进一步探究生物海绵铁体系在脱氮过程中的类Fenton作用以及其他作用力的贡献度占比。本文以人工模拟废水为研究对象,
学位
目的:本研究通过对取消药品加成政策实施前后某市主要慢性病患者的住院费用进行分析,了解政策实施前后慢性病患者的基本情况和住院费用、医疗保险费用的构成。在此基础上,本研究通过分析取消药品加成政策实施前后主要慢性病患者的住院费用和医保费用的变化情况,评价取消药品加成政策对慢性病患者住院费用的影响,为政府相关部门开展医药卫生体制改革提供实证数据支撑和政策建议。方法:本研究为回顾性研究,数据来源于某市医疗保
学位
目的:分析血清尿酸变化与颈动脉粥样硬化对脑卒中发病的影响,颈动脉粥样硬化对血清尿酸变化与脑卒中发病的中介效应,以及颈动脉粥样硬化与代谢性指标的并行多重中介作用,为理解血清尿酸变化与脑卒中发病风险的因果关联提供理论依据。方法:本研究依托金昌队列平台,选取基线和两次随访全匹配人群资料,以基线血清尿酸及血清尿酸变化,第一次随访颈动脉粥样硬化为研究因素,以第二次随访新发脑卒中为研究结局,开展前瞻性队列研究
学位
日光温室的发展,解决了长期困扰我国北方地区冬季鲜菜生产和供应的问题,极大地丰富了城乡居民的“菜篮子”。使传统的农业生产由“冬闲”变成了“冬忙”,提高了农民收入。然而,我国虽有世界第一的设施农业种植面积,产量仅为发达国家的1/3,甚至更低,这主要是由于我国在设施农业的相关基础研究比较薄弱且缺乏系统性。许多温室在建造时加热、降温、通风等系统不完善。温室结构简易,仅具备简单的防雨、保温功能,容易受到雨雪
学位
目的分析甘肃省两轮新冠肺炎确诊病例的流行病学特征;了解确诊病例在县(区)层面的空间聚集性及分布模式,识别发病热点区域;综合评价甘肃省疫情防控策略效果,为科学制定常态化疫情防控策略提供依据。方法(1)运用描述性统计分析方法,分析甘肃省2020年、2021年两轮新冠肺炎疫情确诊病例的人群、时间、地区等流行病学特征。(2)运用全局空间自相关、局部空间自相关分析方法,分析各时间段确诊病例的全局自相关性和局
学位
随着互联网共享经济快速发展,使共享单车系统成为互联网倡导形式下最为典型的共享经济模式,共享单车系统基于低碳经济和即走即停特点,有效解决了城市交通方式中用户出行“最后一公里”问题。随着共享单车行业快速发展,相关问题也随之出现,如共享单车的肆意停放严重影响城市容貌,共享单车投放点的不合理布局使用户取车还车困难、距离用户远,一定程度上降低用户对于共享单车交通方式的使用率,且共享单车初期投资成本高,运营成
学位
目的:对我国1990-2019年的结核病发病与死亡趋势进行分析,了解结核病的发病与死亡变化趋势及其相关影响因素,并对30年间我国防治政策文本进行研究,评价其防治效果,为制定我国结核病的科学防治政策与措施提供依据。方法:将我国1990-2019年结核病的发病与死亡数据(数据来源于全球健康数据交换数据库)进行整理分析,分别对我国30年间全人群、男性及女性结核病的发病与死亡变化及现状进行描述。通过建立的
学位
目的分析非酒精性脂肪性肝病(NAFLD,Non-alcoholic fatty liver disease)、代谢相关脂肪性肝病(MAFLD,Metabolic dysfunction-associated fatty liver disease)患者及各亚组人群主要心血管病(CVD,Cardiovascular disease)发病风险,并采用两种预测模型进行高危人群CVD发病风险的预测对比研究
学位