自从创新理论在1912年被熊彼特在《经济发展理论》提出以来，创新对经济增长的作用日益受到重视和肯定。研发投入活动(R&D)作为创新的关键来源，也随之成为学术界关注的焦点和热点。虽然有不少学者对于企业的创新行为及影响因素已经进行了研究，但是目前从地域差异和行业差异角度研究企业微观层面的研发行为决策和研发产出绩效的文章仍然凤毛麟角，从企业研发投入及空间溢出角度来研究企业产出绩效的研究成果几乎空白，因此本文的研究具有一定的理论和现实意义。本文在理论方面，梳理了大量文献，在此基础上，构建了企业研发行为决策理论模型和包含研发投入及其空间溢出作用的企业研发产出绩效理论模型，形成本文研究探索的理论基础。在实证分析层面，基于本文的理论框架，首先对企业研发行为决策方程进行了Probit随机效应的面板回归，研究结果表明：(1)从内部因素上来看，企业规模每增加1%，企业进行研发的概率就提高0.03个百分点，验证了熊彼特假说。另外，资产负债率越低、资产流动比率越高、盈利能力都有利于提高企业的研发可能性。(2)从外部因素来看，垄断的行业结构更利于企业进行研发，出口、人力资本和政府对研发的支持力度均显示了积极的促进作用。其次本文考察了研发投入及其空间溢出效应对企业产出绩效的影响差异，我们发现：(1)研发投入每增加1%，新产品和增加值分别提高0.05个百分点和0.0021个百分点，但对增加值的产出影响比较微弱，说明目前我国企业的研发投入主要还是以产品创新为主。(2)其他地区的研发溢出每增加1%，新产品产出下降0.17个百分点，工业增加值产出提高0.23个百分点，这意味着研发空间溢出对新产品的产出产生了负效应。研发溢出效应在劳动密集型和资本密集型行业中同样表现为负外部性，但是技术密集型行业却没有受到影响。在中部和西部地区则表现为负，但在环渤海和东南地区研发溢出效应则表现为显著的正外部性。这一方面说明行业和区域位置的影响具有复杂性，另一方面也反映了高新技术行业和经济发达地区在吸收消化其他地区研发溢出的能力上较强。