GLYATL1基因在肝细胞癌患者中的表达及其潜在作用

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wylaaram
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研究背景肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是我国原发性肝癌的主要类型,是世界范围内常见的恶性肿瘤之一。根治性或姑息性肝切除术仍然是HCC治疗最有效的策略。但肝癌的发病机制尚未阐明。因此,迫切需要进一步研究肝癌的发病机理,鉴定与肝细胞癌相关的新型分子标记物。甘氨酸-N-酰基转移酶样1(Glycine-N-Acyltransferase Like 1,GLYATL1)在生理状态下参与酰基辅酶 A的解毒,在外源性生物代谢中促进谷氨酰胺代谢。文献报道GLYATL1在前列腺癌、三阴性乳腺癌等多种恶性肿瘤中起重要作用。然而,GLYATL1在HCC中的表达情况及具体作用仍然存在疑问。研究目标通过利用多种在线数据库和免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)探究GLYATL1在HCC组织及对应癌旁组织的表达情况,并进一步分析其表达水平与临床病理参数及预后的关系。此外,通过数据库进一步探究GLYATL1在HCC发生潜在的机制。方法在Oncomine数据库中检索GLYATL1 mRNA在HCC中的表达情况,并在基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库及人类蛋白质表达图谱(The Human Protein Atlas,HPA)中验证其表达水平。通过IHC检测GLYATL1蛋白在HCC癌及癌旁组织中的表达,进一步根据GEPIA数据库及本中心临床标本检测的GLYATL1表达水平分析其与HCC患者临床病理特征及预后的相关性。然后,通过STRING数据库构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络。最后,利用基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)来识别统计学显著的通路,以及基于肿瘤免疫估计资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库,探索GLYATL1在肝癌谷氨酰胺代谢中的作用。结果Oncomine数据库及GEPIA数据库均证实,与相应的癌旁组织相比,HCC中GLYATL1的mRNA的表达水平明显下降(p<0.05)。HPA数据库及IHC结果证实,GLYATL1主要表达在肝细胞的细胞质,HCC中GLYATL1的蛋白表达量显著下降(p<0.05)。进一步生存分析表明,GLYATL1低表达提示HCC患者的预后差,而且其表达与组织学分级、TNM分期、患者复发状态正相关(p<0.05)。PPI网络分析表明,GLYATL1与CNGA3、GNB5等10个核心基因存在相互作用。最后GSEA的结果证实低表达的GLYATL1显著富集到胆汁酸代谢、异物代谢、脂肪酸代谢、凝血、过氧化酶体和脂肪生成的通路。GLYATL1的表达与多种线粒体谷氨酰胺代谢相关基因的表达显著相关。结论GLYATL1在HCC组织中下调,并且提示患者预后不良,与组织学分级、TNM分期、患者复发状态相关,有望成为评估HCC患者预后的生物学标记物,可以为探究肝癌发生的机制提供重要的方向。
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