RVVC患者阴道微生物构成及其动态变化与发作的相关性研究

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研究背景每年全球复发性外阴阴道假丝酵母菌病超过1.38亿人。而探究复发性外阴阴道假丝酵母菌病发作时阴道微生物物种的动态变化情况,可进一步明确RVVC复发的机制以及望为其临床治疗提供理论基础。目的通过建立队列,获得RVVC患者复发周期内的多个阴道微生物组标本,揭示RVVC发作周期的微生物组组成变化,从RVVC患者阴道微生态系统结构和功能变迁的角度阐述RVVC复发机制。方法招募了 14名RVVC患者,需连续取材,最终6名RVVC患者纳入本课题研究,分析基本资料后完成以下操作。(1)RVVC患者队列的建立与阴道微生物群落结构分析建立RVVC队列,每天采集阴道分泌物,可以捕捉间歇期和发作期结构和功能的动态变化信息。通过BIPES能够同时分析RVVC复发前后阴道微生物群落细菌16SrRNA和真菌18SITS结构变化。(2)绘制动态菌谱图,筛选并确定RVVC发作关键时间节点动态队列采样并绘制动态菌谱图,可以直观展示出RVVC患者的菌群波动情况,为确定RVVC发作关键时间节点提供基础数据。结果1.通过使用BIPES流程对样本数据进行分析,随后使用UCHIME对嵌合体序列进行摘除,6个RVVC患者的样品数量为235个,测序共获得18,273,380对Reads,双端Reads质控、拼接后共产生16,192,661条Clean Reads,每个样品至少产生 39,517 条 Clean Reads,平均产生 68,905 条 Clean Reads。2.在 Alpha 生物多样性分析中通过 Chaol、Observed species、PD whole tree、shannon四个指标的观察发现在普氏菌属增多时,物种的多样性指数最多,乳酸杆菌优势或加德纳菌优势时物种的多样性指数均低。3.从菌属水平上,复发性外阴假丝酵母菌病在发作时的菌群结构构成与稳定期状态下相似,以乳酸杆菌为优势菌群,在发作前的24天中,第1天出现了以普氏菌属上升,在6-12天出现了以普氏菌属、加德纳菌为优势菌群的状态。结论1.复发性外阴阴道假丝酵母菌病患者的稳定期以乳酸杆菌为优势菌群,在患者的疾病活动期中,乳酸杆菌的比例显著降低,加德纳菌为主要优势菌,普氏菌属、双歧杆菌等菌属的丰度开始提升。2.加德纳菌丰度开始提升时,复发性外阴阴道假丝酵母菌病开始进入活动期。在加德纳菌的丰度下降时复发性外阴阴道假丝酵母菌病转进入稳定期,在进入以乳酸杆菌为优势菌的微生态环境时,复发性外阴阴道假丝酵母菌病处于稳定期。3.通过第二代高通量测序检测16SrRNA基因能够有效预测出复发性外阴阴道假丝酵母菌病的发作时间,以及疾病预后改变的主要拐点。
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