入侵种和土著种之间存在的生态学差异是抽象的概念,且很难量化,生态学家基于现代物种共存理论从亲缘关系和性状差异的维度综合一系列入侵机制假说强调物种之间的生态位差异和适合度差异对入侵成功的影响,强调入侵种在这两方面的独特性。菊科（Asteraceae）是中国具入侵植物数目最多的类群,也是危害性最为严重的科之一。本研究通过分析菊科28种不同等级入侵植物的种子功能性状特征,40个入侵种与其38个土著种的叶绿体基因组特征差异及亲缘关系,来探究生态学差异对菊科植物入侵性的影响,为入侵生态学理论提供更多的例证。主要结果如下:（1）种子功能性状与入侵性的关系:菊科入侵性强的物种其瘦果通常较小且具冠毛,部分瘦果较大但具芒刺、宽翅等特殊附属结构,具有多样的传播方式;种子活力较强,萌发速度快等优势性状,提高了入侵种对环境的适合度,有利于在入侵初期克服小种群限制,还加剧传播扩散,促进入侵成功。（2）中国菊科入侵种与近缘土著种的叶绿体基因组特征:菊科入侵种与近缘土著种的叶绿体基因组大小为150356～153318 bp,均呈典型的四分体结构,总GC含量在37%～37.8%之间,通常含有132～134个基因,在CDS基因（85～87）、t RNA基因（36～37）、r RNA基因（8）和假基因（2～4）的数量与分布上相对保守;基因数量的变化主要与基因丢失和假基因化有关。（3）叶绿体基因组特征与入侵性的关系:菊科多数入侵性强的物种相对于其近缘土著种,叶绿体基因组较大,主要与IR区边界区域扩张以及较多的SSR和串联重复序列有关。能够促使入侵种承受复杂环境造成的不利突变,维持叶绿体基因组结构稳定,也有利于保留对物种有利的变异,促进功能基因的适应性进化;菊科入侵种与土著种之间部分光合系统（psb H、pet D、atp F、ndh C、ndh K）、遗传系统（rpo A、rpo C1、rps8、rps15、rps12、rps19、rpl16）和其他参与生物合成（acc D、mat K、clp P、ycf1、ycf2）的功能基因高度变异,正在经历适应性进化,提高了入侵种对环境的适合度,有利于增加入侵种对异质环境的耐受力。（4）菊科入侵种与土著种的亲缘关系与入侵性的关系:菊科入侵种与土著种的亲缘关系表征的是生态位差异,入侵种与近缘土著种生态位差异小,竞争激烈不利于入侵,与土著种亲缘关系较远的入侵种更容易入侵成功,符合达尔文归化假说。本研究通过对菊科入侵植物的种子功能性状特性以及入侵种与土著种叶绿体基因组适应性进化和亲缘关系进行研究,表明菊科入侵植物往往通过提高入侵种的适合度或者降低入侵种与土著种之间的适合度差异以及在适合度较低的情况下建立较大生态位差异的方法来促进入侵成功,符合“现代物种共存理论”。