目的:结直肠癌是常见的恶性消化道肿瘤。结直肠癌肝转移是结直肠癌致死的重要因素,但目前对于结直肠癌肝转移的分子机制仍不十分明确。近年来,全外显子组测序对于研究疾病特别是恶性肿瘤的发生发展扮演越来越重要的角色,其高通量低成本的优势让研究者可以从基因组学层面探寻疾病的致病基因并筛选潜在的分子标志物和治疗靶点。本研究利用全外显子测序技术,初步探讨与结直肠癌肝转移有关的基因改变,以期对后续的深入机制研究及靶向干预策略研究提供数据支持。方法:收集苏州大学附属第一医院普外科收治的六例结直肠癌肝转移手术患者的原发灶、配对的癌旁正常肠组织、肝转移灶标本并进行全外显子测序,测序深度为98.45X-217.98X。将测序得到原发灶与肝转移灶肿瘤样本的cleanreads与匹配的癌旁正常肠道样本的clean reads进行校准及比对,得到肿瘤样本的SNP和InDels,进一步进行数据过滤,使用ANOVAR软件对找到的SNP和InDels参照基因数据库进行注释,与疾病相关的变异用Clinvar、OMIM、COSMIC70进行注释。将肝转移灶突变基因与原发灶突变基因进行比对,得到差异表达基因,并使用GO和KEGG进行基因的功能富集分析。结果:我们在结直肠癌原发灶以及肝转移组织共发现了 10228个SNV和518个IndDel,包括 OBSCN、MUC4、HIPK2、CDC42BPB、IGFN1 等多个潜在的与结直肠癌发生发展相关的基因,对高频突变基因进行GO和KEGG Pathway分析,发现高频突变基因主要集中在GO的分子功能（molecular function）的分子结合（binding）与分子催化活性（catalytic activity）,细胞组分（cellular component）的细胞组成（cell）、细胞器组分（organelle）与细胞部件组分（cell part）,参与的生物过程（biological process）的细胞间质过程（cellular process）、代谢过程（metabolism process）与单组织进程（single-organism process）。KEGG Pathway分析显示所有结直肠癌肿瘤样本和肝转移样本的高频突变基因主要分布在昼夜调节（circadian entrainment）、胰岛素分泌（insulin secretion）、细胞外基质受体相互作用（ECM-receptorinteraction）、醛固酮合成与分泌（Aldosterone synthesis and secretion）、环腺苷酸信号通路（cAMP signaling pathway）、长时程抑制效应（long-termdepression）以及谷氨酸能突触（glutamatergic synapse）等通路上。我们进一步将肝转移灶与结直肠癌原发灶的测序数据比对,发现MUC4、IQSEC3、TTN等显著差异表达基因。GO分析显示这些差异表达基因主要集中在分子功能的分子结合与分子催化活性,细胞组分的细胞组成、细胞器组分与细胞部件组分,参与的生物过程的细胞间质过程、代谢过程与单组织进程。KEGG pathway分析显示差异表达基因主要集中在昼夜调节、催产素信号通路（Oxytocin signaling pathway）、钙信号通路（Calcuim signaling pathway）、细胞外基质受体相互作用、环腺苷酸信号通路等通路上。结论:本研究通过对结直肠癌肝转移患者相关组织进行全外显子组测序,初步揭示了部分与结直肠癌发生以及结直肠癌肝转移相关的候选基因,有望为结直肠癌肝转移患者的后续研究提供新的标记分子和调控靶点。